Single cell RNA-seq analysis workshop / 开普饭

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一.单细胞single cell RNA-seq简介 1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq) Measures the average expression level for each ...

CSC – IT科学中心是芬兰国家和高等教育机构拥有的芬兰信息技术专业中心.为高等教育机构,研究机构,文化,公共管理和企业提供国际优质的ICT专家服务,以帮助客户蓬勃发展并造福整个社会. 每年,他们都 ...

这个课程中你将会学到以下内容: ·进行质量控制并过滤出低质量的细胞·标准化基因表达值·消除不必要的变异来源·选择可变基因·执行降维(PCA,tSNE,UMAP,CCA)·簇细胞·查找簇的标记基因·整合 ...

简单介绍下 <ANALYSIS OF SINGLE CELL RNA-SEQ DATA> Orr Ashenberg Dana Silverbush Kirk Gosik 02/25/20 ...

single cell, single cell, single all the day...又到了一周一更的生信工作咨询速递环节了,距离上次更新已经过了12天了, 要是今天再不更新的话,我估计会被B ...

之前也读过一些总结单细胞方法的文章,但是大多都将单细胞转录组的原理和方法混为一团,比如把CEL-seq,同SMART-seq并列讲原理,这无可厚非,但是又把Drop-seq和Split-seq等也一同 ...

首先我们先来回顾一下上一期讲到的Single cell RNA-seq 的原理,首先是2006年末端加A形成第一链cDNA的方法奠定了后来的单细胞转录组测序的问世,2009年,二代测序的发展结合末端加 ...

RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具.RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面:从转录本在何时何地转录到RNA ...

最近在画UMAP的时候发现有的时候细胞亚群的注释与点重合颜色上不是很搭配,同事提出让注释"支棱"起来,首先想到的是ggforce中的geom_mark_ellipse,实践中遇到一 ...

协同进化(Coevolution)一词,是在 1964 年由 Ehrhich 和 Raven 首次提出,用以阐述昆虫与植物进化历程中的相互关系.在植物进化出一系列的抗虫防御反应的同时,昆虫也在不停地进 ...

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