技术贴 | 物种内部基因的共线性分析 / 开普饭

▼分类: 生物信息学1:软件网址:https://ccb.jhu.edu/software/glimmerhmm/2:下载近源物种的gff文件以及基因组序列,这个近源物种的寻找,个人的方法就是搞清楚你 ...

比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...

界面布局界面布局(Layout)是用户界面结构的描述,定义了界面中所有的元素.结构和相互关系声明Android程序的界面布局有两种方法使用XML文件描述界面布局在程序运行时动态添加或修改界面布 ...

无限个!物种共线性分析结果可视化 MCscan是相对广泛使用的基因组共线性分析软件.其输出了非常丰富的结果,可以用于推断基因组复制时间,分析基因家族扩展等. 先放一张能看的图支持无限个物种同时展示( ...

写在前面近年来,高通量测序费用持续走低.大多数课题组完全有经费可以支撑起自己所研究材料的基因组测序更或者可以非常容易地从网络上获取基因组序列与基因结构注释信息.于是会开始存在这样那样的,关于比较基因 ...

写在前面类似的主题,我们已经推出了一篇主题为<一键完成共线性(MCScanX)分析>的文章.推出之后一部分人用着挺好.也有相当部分朋友却不知为何遇到各种各样的问题.这些问题,源于输入文件 ...

majer @ 2021.04.25 , 21:40 章鱼的种类非常庞杂,隔三差五,海洋学家就能发现一些之前未记录在案的生物. 以往确认新的章鱼物种通常需要解剖.而刚刚被确认的Grimpoteuthi ...

编译:微科盟伊一,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读作物野生亲缘物种的祖先适应性可以为作物改良提供遗传储备.在这里,研究者记录了野生和栽培鹰嘴豆的轻度和重度干旱胁迫的生理变 ...

编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读酪丁酸梭菌(Clostridium Tyrobuyricum)是一种有前途的生产生物燃料的微生物.本研究发现酪丁酸梭菌中过表达吸氢酶 ...

在填报志愿的时候,大部分家长都喜欢看名字选专业,有些名字不好听的专业,根本就吧去了解,导致错过了很多性价比很高的专业,本文小编就和大家分享一个名字叫的不是那么太好听,但是性价比非常高的专业,测控技术与 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读箱型图(Boxplot)或者盒图是一种能同时展示一组或多组数据的极值.四分位数.中位数和离群值,显示数据离散情况的统 ...

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