任何人！一键完成物种间的共线性分析与可视化 / 开普饭

比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...

无限个!物种共线性分析结果可视化 MCscan是相对广泛使用的基因组共线性分析软件.其输出了非常丰富的结果,可以用于推断基因组复制时间,分析基因家族扩展等. 先放一张能看的图支持无限个物种同时展示( ...

本文由沐子星根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读今天我们学习物种内部的基因共线性分析,基因的共线性分析在基因家族类分析中很常见,通常基因家族主要通过串联重复.片段复 ...

写在前面近年来,高通量测序费用持续走低.大多数课题组完全有经费可以支撑起自己所研究材料的基因组测序更或者可以非常容易地从网络上获取基因组序列与基因结构注释信息.于是会开始存在这样那样的,关于比较基因 ...

编译:微科盟东方不赢,编辑:微科盟景行.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读番茄果实的成熟是一个紧密协调的复杂生长过程,涉及多种生理过程和代谢变化.成熟使果实更诱人,可口,富有营养.成熟 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肿瘤浸润性髓样细胞(TIMs)由单核细胞.巨噬细胞.树突状细胞和中性粒细胞组成,已成为肿瘤生长的关键调控因子.这些细胞可以分化成一系列 ...

推荐:江舜尧编译:Hancactus 编辑:小菌菌近日,瑞尔森大学的Lindsay M. D. Jackson等人在微生物学权威期刊Frontiers in Microbiology发表题为< ...

写在前面 TBtools不断地更新,慢慢地能够完成越来越多生信下游数据分析中相对繁琐的小人物.与此同时,TBtools也不断推出了让所有人都能完美绘制一些发表级的图片的功能.机缘巧合之下,有不少做基因 ...

写在前面伴随着越来越多的全基因组序列公布,比较基因组分析已然常规生信数据分析技能.MCScan 是最为常用的软件之一.久前,TBtools 已经将该软件打包,同时开放了一键化流程.用户只需要输入四个 ...

上周小编和大家聊了欧洲小麦对气候波动性的适应性的文章(舶来赏析-现代育种体系降低了欧洲小麦对气候波动的适应性?(PNAS 2019)).全球气候变暖,极端天气越来越频繁,小麦人越来越关注这一方面,最怕 ...

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