CNS图表复现17—inferCNV结果解读及利用之进阶 / 开普饭

上回咱们读完了pose_estimation_2d2d.cpp这个文件,基本上明白了通过对极几何计算相机位姿变换的过程,简单地说就是:你给我两帧图像,我给你算个R.t. 我们按部就班,跟着小绿来看一下 ...

四氢生物喋呤缺乏症(tetrahydrobiopterin deficiency, BH4D)是高苯丙氨酸血症(HPA)的一种亚型,是一种常染色体隐性遗传病,与苯丙酮尿症(PKU)同属于 HPA是截至 ...

上回咱们读完了pose_estimation_3d2d.cpp这个程序,也找到了3d-2d位姿估计与2d-2d位姿估计之间的联系与差别: 在2d-2d使用对极几何求解相机位姿时直接调用了OpenCV提 ...

前言前面我们提到了因为细胞数量比较多,运行infercnv::run的时候,下面两个参数,都是默认值即可: HMM参数 when set to True, runs HMM to predict C ...

前言前面我提到了,我好文章都是取全部的上皮细胞,以及部分Fibroblasts和Endothelial_cells细胞来一起运行inferCNV流程.但是呢,自己的数据里面,是 366 gene ...

前言我在CNS图表复现09-上皮细胞可以区分为恶性与否,简单演示了,第一次分群后选择上皮细胞后继续分群,第1,2,7,14,21,23,25 是跨越病人的聚类情况,所以初步判定它们这些亚群是正常的上 ...

前言前面我们的教程讲到了,自己取全部的上皮细胞,以及部分Fibroblasts和Endothelial_cells细胞来一起运行inferCNV流程,但是得到的结果很诡异,明明是作为二倍体正常细胞参 ...

上个月我们组建了:<单细胞CNS图表复现交流群>,见:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞),也分享了单细胞转录组数据分析的流程: 祖传的单个10x样本的seurat标 ...

上个月我们组建了:<单细胞CNS图表复现交流群>,见:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞),也分享了单细胞转录组数据分析的流程: 祖传的单个10x样本的seurat标 ...

回顾我们的CNS图表复现之旅已经开始,前面3讲是: CNS图表复现01-读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象 CNS图表复现02-Seurat标准流程之聚类分群 CNS图表复现03-单细胞区 ...

回顾我们的CNS图表复现之旅已经开始,前面4讲是: CNS图表复现01-读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象 CNS图表复现02-Seurat标准流程之聚类分群 CNS图表复现03-单细胞区 ...

回顾我们的CNS图表复现之旅已经开始,前面5讲是: CNS图表复现01-读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象 CNS图表复现02-Seurat标准流程之聚类分群 CNS图表复现03-单细胞区 ...

CNS图表复现17—inferCNV结果解读及利用之进阶