16s分析之Qiime中一些常用的命令学习笔记 / 开普饭

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还记得昨天最后一条命令吗? single_rarefaction.py -i otus/otu_table_mc2_w_tax.biom -ootu_table_even6073.biom -d 60 ...

首先Qiime官网命令都集中在这个网址,大家可以收藏,随用随查: http://qiime.org/scripts/index.html 这次我们关注的是聚类OTU,与其相关的命令如下: 这里主要有三 ...

摘要: 下面开始运行,提取我们需要的文件: cp -r ~/Desktop/Shared_Folder/gzhcs/ ~/Desktop/ 进入工作目录,查看文件(我随便找了两个测序文件,两组每组三个 ...

Qiime质控很快,但是去除嵌合体就不那么迅速了,上次16s分析之Qiime序列拼接没有给出数据和运行界面,可能体验会差一些,这次我给加上: 先说说质控命令: split_libraries_fast ...

摘要: join_paired_ends.py:该命令默认调用fastq-join,因此可以不用设置-m选项,若选用SeqPrep则需要设定-m选项 -m调用方法fastq-join, SeqPrep ...

听刘儒德教授的讲座,全程都感觉被他用心理学的理论审视.虽然,他并没有审视到具体的某一个人,但是会场的这个场域已经全然落入他的眼中. 从他的讲座中,真的是可以感受到这是一个基于课堂 ...

省中医经常用的11种中成药,为家人收藏起来,早晚用得上! 1. 房颤心跳快体力疲乏--"守护神"--(仙茸护肾胶囊) 药理:温肾健脾.适用于腰膝酸软,畏寒肢冷,神疲乏力,自汗气短, ...

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