ADAR1基因敲除前后肿瘤免疫微环境单细胞水平变化 / 开普饭

A benchmark of batch-effect correction methods for single-cell RNA sequencing data对单细胞RNA测序数据的批次效应校正 ...

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

与传统的转录组测序相比,单细胞测序技术噪声很大,使得单细胞转录组数据包含大量的dropout事件(导致基因表达量为0或接近0),即使是一些标记(Marker)基因也有可能表达量很低.当在使用其对聚类的 ...

黑色素瘤是一种始于皮肤色素细胞(黑色素细胞)的皮肤癌,与其他类型的皮肤癌相比不太常见,但其严重性在于,如果不及早治疗,它会扩散到其它器官.近75%的患者尸检显示,黑色素瘤已转移至中枢神经系统 (CNS ...

我注意到绝大部分肿瘤相关的单细胞转录组研究的落脚点都是在肿瘤免疫微环境个细胞亚群比例,包括 B细胞,T细胞,巨噬细胞,树突细胞等等,而且这些细胞亚群都是可以继续细分.但实际上在没有单细胞转录组数据这个 ...

前面我在<生信菜鸟团>公众号介绍了小鼠的肿瘤免疫微环境推断可以用seq-ImmuCC,本来是想布置作业让大家下载https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproje ...

导语今天和大家分享的是2021年1月份发表在Cancers杂志(IF=6.126)的一篇文章"Immunogenomic Gene Signature of Cell-Death Asso ...

前言肿瘤创造了一个局部肿瘤微环境(TME),由不同的细胞类型.细胞外基质成分和支持肿瘤生长和进展的可溶性因子组成.TME通常具有高度的免疫抑制作用,阻止免疫细胞清除癌细胞,从而对癌症免疫治疗产 ...

肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)是一个复杂.异质性的环境,由基质细胞.内皮细胞以及被招募的免疫细胞组成.其特征是血管渗漏.特殊的肿瘤特异性细胞外基质(ECM).细胞因 ...

前言在过去的十年里,免疫疗法的出现确实彻底改变了癌症治疗的模式.许多靶向程序性细胞死亡蛋白-1(PD-1)或其配体(PD-L1)的治疗药物已被监管机构批准作为单一治疗药物,或与化疗和其他靶向药物联合 ...

肿瘤一直是困扰人类的一个难题,随着癌症发病率的升高和日益年轻化的趋势,全世界的科研人员都集中了大量的人力物力进行肿瘤相关的研究和肿瘤的治疗.近几年,免疫治疗开始出现,随着免疫治疗疗效的不断提高,得到了 ...

虽然MC目前2018年的IF是10.679,但是我们之所以说是15+分呢,是因为MC在6月就要公布在2019年的影响因子是15.96分,说不定还能在这段时间努努力,突破到16分! (图片来源:桑格助手 ...

ADAR1基因敲除前后肿瘤免疫微环境单细胞水平变化