肿瘤细胞系多组学加上药物作用数据库-CCLE / 开普饭

前段时间我们在对 [[CCLE-肿瘤细胞系百科全书 v2.0-数据下载]] 新的使用方式进行了系统的讲解.其中提到了 [[DepMap Portal-肿瘤细胞系综合分析数据库]] 这个工具.在这个工具 ...

相信大家都听说过CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)(https://portals.broadinstitute.org/ccle).简单来说,这个数据库做了很多细 ...

领域:癌症杂志:Nature & Nature Medicine 亮点: 1)1篇Nature论文描述了癌细胞系百科全书(CCLE)大型文库的重大升级,首次提供了超越中心法则的数据 2)1 ...

编译:晨曦,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读细胞代谢涉及一系列高度协调的活动,在这些活动中,多种酶系统协同工作,将营养物质转化为大分子.能量货币和生物群落的基本单元.目前还没有包 ...

在昨天的推送当中,我们介绍了现在的 CCLE 数据库的一些基本信息.同时也提到了一个用来分析 CCLE 的在线的数据库:DepMap Portal (https://depmap.org/portal ...

前段时间一个汇总了多个基因组 CRISPR 数据的数据库:[[BioGRID ORCS-CRISPR筛选数据库]].同时之前也介绍了一个肿瘤细胞系相关的 CRISPR 数据库 [[DepMap Por ...

对于肿瘤细胞系的分析,之前我们介绍过 .但是随着CCLE系统的升级.之前介绍的一些功能基本上也用不了.按照之前的帖子,我们在进入CCLE网址之后,界面变成了下面的这个样子.所以为了更好的时候使用CCL ...

之前我们介绍了很多TCGA方面的数据库.其中GEPIA只能用来分析表达数据库各个方面的.cBioPortal可以进行多组学分析,但是一般都是分析自身基因和自身突变等等的关系.至于CVCDAP分析的则是 ...

之前我们在介绍GEPIA的时候,说这个数据库只能用于TCGA表达数据的一些分析.但是对于TCGA数据而言,里面包括相同样本的表达.突变.拷贝数.甲基化以及临床信息等数据,所以我们其实可以利用TCGA数 ...

之前我们在介绍GEPIA的时候,说这个数据库只能用于TCGA表达数据的一些分析.但是对于TCGA数据而言,里面包括相同样本的表达.突变.拷贝数.甲基化以及临床信息等数据,所以我们其实可以利用TCGA数 ...

影像组学描述了从影像图像中提取定量特征的一系列计算方法.其结果常常被用于评估影像诊断,预后以及肿瘤治疗.然而,在临床环境中,优化特征提取和快速获取信息的方法仍然面临重大挑战.同样重要的是, ...

编译:cell_ysc,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读疾病的代谢重编程近来引起人们极大的兴趣,被认为是新一代癌症的标志.尽管放射性同位素标记技术在早期代谢研究中处于主导地位 ...

导读基于质谱(MS)的代谢组学是代谢组分析的流行平台.已经建立了用于处理MS原始数据的计算技术,例如特征检测,峰对准以及排除假阳性峰.非目标代谢组学的下一阶段将是破译小分子的大规模碎片,以全面鉴定人 ...

最近,研究人员揭示了由肿瘤干细胞(CSC)产生的称为"外泌体"的小"信使"囊泡的分子特征,这些囊泡在恶性黑色素瘤患者血液中的肿瘤发展和转移过程中起着关键作用. ...

肿瘤间质是肿瘤组织中除肿瘤细胞外其他成分的统称,肿瘤间质和肿瘤细胞相互作用共同决定肿瘤的生物学行为 (生长,浸润,转移等).早期针对肿瘤治疗的思路往往局限于肿瘤细胞本身,致使人类的抗肿瘤征途异常艰难曲 ...

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