肿瘤细胞系综合性分析数据库 / 开普饭

今天给大家带来的是2020年4月发表在Cancer Res.(8.378)杂志上的文章"Single-cell Proteomic Profiling Identifies Combined ...

癌细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)是一个肿瘤细胞系多组学加上药物作用数据库.网址:https://portals.broadinstitute.o ...

最近接到粉丝求助,他看到了一个很简单的肿瘤单基因数据挖掘文章:A TP53-associated gene signature for prediction of prognosis and ther ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2415天 lncRNA数据库中的多面手由于今天这款lncRNA数据库实在是重磅,我就直接告诉大家吧,不管你是做基础研究还是做疾病研究,不管你是研究肿瘤还是非肿瘤,不管你 ...

系列目录 2019-10.预测BRCA基因功能缺陷的HRDetect基因集(逆向收费读文献) 2019-11 BRCA的甲基化信号分型(逆向收费读文献2019-11)赠送一篇文章思路 2019-12 ...

遇到了粉丝的一个超级好的问题: 感兴趣的一个基因A,研究它在10种乳腺癌细胞系中的表达情况,跑了western和qpcr . 发现它只在一种乳腺癌细胞系中表达,其他9种都不表达. 结果是一致的,确认 ...

对于 miRNA 的数据库而言,之前我们介绍的 miRNA 的数据库主要还是集中在 miRNA 靶基因预测方面的. 1. [[miRactDB-肿瘤当中miRNA靶点预测数据库]] 2. [[miRN ...

作图丫聚焦生信技能,前沿文章,个性绘图以及生信技能培训.有兴趣的小伙伴快来关注吧! ---------分割线---------- 对于相互作用分析的而言,我们之前介绍过STRING.BioGRID和C ...

分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...

在做肿瘤研究的时候,我们现在都知道可以提前查一下基因的表达和临床特征有没有相关性 ,这样对我们的下一步实验也是一个预测的方向.经典的我们可以使用TCGA的数据来进行分析,我们之前介绍的GEPIA就可以 ...

对于肿瘤细胞系的分析,之前我们介绍过 .但是随着CCLE系统的升级.之前介绍的一些功能基本上也用不了.按照之前的帖子,我们在进入CCLE网址之后,界面变成了下面的这个样子.所以为了更好的时候使用CCL ...

髌骨骨肿瘤及肿瘤样病变分析 2017-11-17 16:35 云影平台刁胜林医生作品,欢迎转发

说起RNA甲基化,在调控基因表达.编辑.稳定性及降解等方面扮演重要角色,相比于 DNA 甲基化,RNA甲基化显得更加复杂,普遍存在于各种生物中.主要包括m1A.m5C.m6A及m7G等.其中m6A甲基 ...

肿瘤细胞系综合性分析数据库