肿瘤相关miRNA综合性分析数据库 / 开普饭

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

YM500v2是用于个人smRNA-seq数据集的miRNA定量,是miR鉴定和新型miRNA预测的集成数据库.YM500v2中包含了YM500之后开发的与miRNA相关的新算法,更重要的是,纳入了8 ...

在昨天的推送当中,我们介绍了现在的 CCLE 数据库的一些基本信息.同时也提到了一个用来分析 CCLE 的在线的数据库:DepMap Portal (https://depmap.org/portal ...

我们人体的基因表达情况是会随着年龄的变化发生变化的.通过了解正常人当中那些基因随着年龄会发生变化,对于研究和年龄有关的疾病也有种重要的作用.今天就来介绍一个年龄有关基因表达数据库:ADEIP (htt ...

之前在一篇NC的文献(如何利用公共数据发NC)当中,提到过一个公开的测序数据(MSK-IMPACT).所以今天就来简单的介绍一下这个数据集.这样,在进行公共数据挖掘的时候,除了TCGA.同时也可以考虑 ...

导语 Lnc2Cancer是一个手动管理的数据库,作者在PUBMED提供了lncRNA和人类癌症之间全面的实验支持的关联.中超过6500篇文献中手动收集了LncRNA与癌症之间的关联,完善了lncRN ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. Cancer-related Data Resources A ...

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

作图丫聚焦生信技能,前沿文章,个性绘图以及生信技能培训.有兴趣的小伙伴快来关注吧! ---------分割线---------- 对于相互作用分析的而言,我们之前介绍过STRING.BioGRID和C ...

当我们拿到一个基因,常规分析它的高低表达及功能后,还能从哪方面入手呢?大家都知道DNA甲基化修饰在人类疾病中发挥重要作用,尤其影响癌的发生发展,所以我们可以来探讨一下目的基因的甲基化情况.之前的推荐的 ...

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