肿瘤蛋白相互作用分析数据库 / 开普饭

自从meta分析贬值了之后,生信数据挖掘成为了国内医生.研究生.博士.教师火爆的发文神器,可是令人头痛的事情来了,生信往往需要学习编程,其中R就必不可少,如果要挖TCGA.SEER,Perl或者Pyt ...

我们的TCGA数据分析系列已经出过几期 TCGA数据分析系列(一) TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2 TCGA数据分析系列(二):UALCAN数据库 TCGA数据分析系列(二):Lin ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

本研究作者旨在探讨钙结合蛋白家族成员S100A16在胰腺癌(pancreatic cancer , PC)中的表达和预后价值评估.首先利用Oncomine检测S100A16在PC等肿瘤中的表达水平及预 ...

Prognostic value of epithelial-mesenchymal transition markers in clear cell renal cell carcinomae EM ...

我们生信技能树和京东联合起来做了一个超级大促销,见: 什么,生信入门全套书籍仅需160,这4本书籍,单独的每一个都在100元价位,但是4个合起来,反而只需要161,相当于每本书才40元人民币,5美元左 ...

相信绝大多数研究肿瘤的科研工作者的工作都离不开某个特定的基因,现在绝大部分的单基因的生信文章也都有这么一个图,我就随便列举一些文章的Figure1 比如再比如再比如再比如再比如再比如再比如 ...

在昨天的推送当中,我们介绍了现在的 CCLE 数据库的一些基本信息.同时也提到了一个用来分析 CCLE 的在线的数据库:DepMap Portal (https://depmap.org/portal ...

分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...

功能蛋白质组学是对蛋白质在功能活性水平(例如表达和修饰)的大规模研究.对诸如癌症等复杂疾病的研究表明,遗传改变并不能说明该疾病的所有原因.蛋白质水平和结构的变化也已显示在肿瘤发展和进展中起关键作用,而 ...

在做肿瘤研究的时候,我们现在都知道可以提前查一下基因的表达和临床特征有没有相关性 ,这样对我们的下一步实验也是一个预测的方向.经典的我们可以使用TCGA的数据来进行分析,我们之前介绍的GEPIA就可以 ...

昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础).对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, ...

对于 miRNA 的数据库而言,之前我们介绍的 miRNA 的数据库主要还是集中在 miRNA 靶基因预测方面的. 1. [[miRactDB-肿瘤当中miRNA靶点预测数据库]] 2. [[miRN ...

髌骨骨肿瘤及肿瘤样病变分析 2017-11-17 16:35 云影平台刁胜林医生作品,欢迎转发

用途:Bazedoxifene hydrochloride (TSE-424 hydrochloride) 是一种有口服活性的,能透过血脑屏障的,非甾体.选择性的雌激素受体调节剂 (SERM),对 E ...

说起RNA甲基化,在调控基因表达.编辑.稳定性及降解等方面扮演重要角色,相比于 DNA 甲基化,RNA甲基化显得更加复杂,普遍存在于各种生物中.主要包括m1A.m5C.m6A及m7G等.其中m6A甲基 ...

肿瘤蛋白相互作用分析数据库