TCGA数据分析系列蛋白相互作用网络 / 开普饭

一.BiNGO的使用 1.数据准备(自己筛选的差异基因) 2.安装插件 3.安装好插件后,就打开插件 4.粘贴差异基因 5.选择相应的参数 6.给GO富集分析起一个名字,然后点击Start BiNGO ...

最近,土笋冻在解读文献的时候发现一篇"超级有趣"的文献,同一个科室靠着同一套路发了2篇相似度很高的文章! 这不,美名其曰:数据集的多次利用! 作者在2020年七月发表在Medici ...

五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧!见:生信必备技能--Cytoscape 下面是cytoscape讲师的笔记一.MCODE插件关于 ...

通过组学测序得到一组基因或蛋白后,对着测序报告中给的热图火山图,很多新手都是很困惑的.对于这些结果,我们还能做些什么,才能对我们的后续研究工作提供真实可靠的提示与帮助呢?能否得知这些基因主要参与了哪些 ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

导读分子伴侣(Chaperones)是参与新多肽折叠过程的细胞因子,在一些条件下,它们还确保多肽形成更大的复合体.分子伴侣通常需要非客户蛋白质(non-client protein)来为特定目标多肽 ...

肿瘤基因组图谱(TCGA)计划是由美国National Cancer Institute(NCI)和National Human Genome Research Institute(NHGRI)于20 ...

所谓工欲善其事,必先利其器,从今天开始,我们来介绍TCGA数据库的使用.今天我们来介绍一款非常容易上手的数库:GEPIA2:http://gepia2.cancer-pku.cn/#index 话不多 ...

UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

前面我们做了TCGA的差异分析,并且用ggplot2验证了差异分析的准确性,TCGA差异分析及ggplot作图验证,而差异分析后一般会又热图和火山图,热图我们之前也有说过热图系列1,R语言学习系列之& ...

前面我们出了一系列的TCGA数据分析教程 TCGA数据分析系列(一) TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2 TCGA数据分析系列(二):UALCAN数据库 TCGA数据分析系列(二):Li ...

所谓工欲善其事,必先利其器,从今天开始,我们来介绍TCGA数据库的使用.今天我们来介绍一款非常容易上手的数库:GEPIA2:http://gepia2.cancer-pku.cn/#index 话不多 ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

TCGA数据分析系列 蛋白相互作用网络