TCGA数据分析系列（二）：LinkedOmics / 开普饭

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

写在前面关于TCGA的数据分析.之前我们推荐过的几个网站.其中GIPIA的话是只是可以分析基因表达的数据,而且在很多文章当中都可以用到.CbIo的在多组学的分析方面也能体现它的价值.今天就给大家再介 ...

之前我们介绍了很多TCGA方面的数据库.其中GEPIA只能用来分析表达数据库各个方面的.cBioPortal可以进行多组学分析,但是一般都是分析自身基因和自身突变等等的关系.至于CVCDAP分析的则是 ...

我写了部分常见的TCGA数据库用法: TCGA的28篇教程-免疫全景图 TCGA的28篇教程-指定癌症查看感兴趣基因的表达量 TCGA的28篇教程-对TCGA数据库的任意癌症中任意基因做生存分析 TC ...

Notch信号通路在癌症中的作用分析基因在癌症中作用的文章,一般都是分析单基因或者基因家族,今天让我们一起通过2021年6月发表在Cancers (IF:6.639)上的文章"A Comp ...

生信论文的套路 ONCOMINE从全景.亚型两个维度做表达差异分析: 临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要: Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性: cBi ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

随着高通量测序技术种类的越来越多,我们经常会拿到相关样本的不同组学的数据.那拿 TCGA 的数据库而言,对于同一个患者,就检测了RNA-seq, miRNA-seq, 甲基化芯片等等多组学的数据.对于 ...

我们生信技能树和京东联合起来做了一个超级大促销,见: 什么,生信入门全套书籍仅需160,这4本书籍,单独的每一个都在100元价位,但是4个合起来,反而只需要161,相当于每本书才40元人民币,5美元左 ...

看到一个研究,根据KIAA1429的表达量把TCGA数据库的乳腺癌患者分组后做生存分析,发现有统计学显著,描述如下: Breast cancer patients were divided into ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2604天黑色素瘤大家好,今天给大家带来一篇比较特殊的肿瘤复现文章,那本文特殊在哪里呢? 首先,这是一篇研究黑色素瘤的文章,相比与乳腺癌,肝癌,肺癌,黑色素瘤的研究人数 ...

前言今天和大家分享的是2020年10月份发表在International Immunopharmacology杂志上的一篇文章(IF=3.9)"BICC1 as a novel progn ...

TCGA数据分析系列（二）：LinkedOmics