多组学在线分析工具 / 开普饭

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

一般来说,数据分析的任何一个点都会有成百上千个实验室在为之努力,比如比对,定量,可变剪切,融合基因这些步骤,那么同时也会有很多工具测评的文章,比如针对融合基因的随便搜一下,就可以发现下面两个: 201 ...

实体瘤肿瘤特异性免疫预后特征及其与免疫检查点治疗的关系首先让我们通过摘要了解下这篇文章的主要内容,为了阐明免疫细胞浸润作为实体肿瘤预后标志的作用,作者分析了四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和TC ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 文章信息 Luecken MD, Theis FJ ...

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics 联合单细胞转录组 ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

引文之前的推文中,我们简单介绍了scATAC-seq的技术原理和发展历程.从本期推文开始,我们将分享scATAC-seq的常用工具和基本的分析流程.scATAC-seq分析工具当中,比较为人熟知的是 ...

环境宏病毒组学分析思路与常用工具袁凌1, 2,倪艳4,鞠峰1, 2, 3 * 1 浙江省海岸带环境与资源研究重点实验室,工学院, 西湖大学, 杭州, 浙江 2 前沿技术研究所, 浙江西湖高等研究院 ...

学TCGA数据库并不是为了发"套路"文章,那些基本上是本科生毕业设计的水准,但是阅读这样的文章的确可以很大程度上帮助大家认识TCGA数据库,主要是了解它可以做什么,比如我昨天在生信 ...

网站介绍 MetaboAnalyst,做代谢组学的小伙伴们必须掌握的一个网站,2009年诞生至今已在代谢组学领域牢牢扎根, SCI论文中经常引用.MetaboAnalyst界面简洁友好易上手,基本涵盖 ...

今天和大家见面的是无菌鼠. 随着基因组学.代谢组学等高通量检测技术的应用,人们逐渐认识到胃肠道微生物群存在巨大遗传多样性和代谢复杂性.这些共生细菌通过与宿主的复杂交互作用调节胃肠道的发育和功能,与营养 ...

免疫系统的重要性,这个自然无需多说,在免疫领域有没有类似于 TCGA 这样的组学数据库呢?免疫组学这样的数据库至少在数据挖掘上现在似乎还是并不多,第一个遇到的问题是啥是免疫组学?白介素同学的理解呢,就 ...

代谢组学是在基因组学.转录组学和蛋白质组学之后升起的系统生物学的一个新的平台,其定义为:定性.定量考察生物体系受到刺激或扰动后其代谢产物的动态变化,揭露机体生命代谢活动本质的科学. 代谢组学力求对生物 ...

2020年,深度学习算法AlphaFold2在从原始序列预测蛋白质三维结构方面取得了里程碑式的成果. 宏基因组学产生的大量测序数据,让人们得已窥见未经培养的微生物的生物合成潜力.与初级代谢途径相比,参 ...

AI 正在推动医疗健康领域进入数字化研发的新时代. "我们正在利用 AI 技术对复杂的免疫学数据.多组学数据进行研究和机制建模,以实现免疫系统甚至生物系统数字化.未来,数字化的生物有机会彻底 ...

Metabolomic and Pathway Changes in Large‐leaf, Middle‐leaf and Small‐leaf Cultivars of Camellia sine ...

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