转录组高级分析之融合基因
相关推荐
-
单细胞RNA
一.单细胞single cell RNA-seq简介 1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq) Measures the average expression level for each ...
-
10x单细胞数据分析之整理参考基因组
与常规的RNA-Seq一样,10x单细胞RNA-Seq/ST-Seq也需要测序数据比对到参考基因组进行基因的定量.那么参考基因组的质量就对单细胞的分析结果有着重大的影响. 接下来小编就给大家介绍一下1 ...
-
谈一谈中国春基因转录水平上的证据
从组装好的基因组序列到基因注释这一步,说简单也简单,说难也难.这里的难是指,在转录水平上做到95%以上的准确率,还是比较困难的.我们前面曾经介绍过基因注释的一些内容. 基因注释一般是指采用生物信息学的 ...
-
茶树挥发物如何响应茶绿叶蝉的采食
Formation of volatiles in response to tea green leafhopper (Empoasca onukii Matsuda) herbivory in te ...
-
转录组的高级分析前该如何标准化数据?
我们在本周推送了两篇关于TCGA数据的使用, 其中伸出我的小脚,将TCGA轻轻绊倒,然后叉腰哈哈笑 一文详细描述了TCGA数据从下载到分析的全过程.在制作表达谱进行下游WGCNA和GSEA分析时,数据 ...
-
科研│J AGR FOOD CHEM:代谢组学和转录组学分析显示蓝光促进草莓中绿原酸的合成(国人佳作)
编译:微科盟 伊一,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 发光二极管已经广泛应用于工厂和农业设施.可以根据不同植物的光质量和强度要求设计不同的发光二极管,从而调节植物的生长发育以 ...
-
科研 | 郑州大学:整合代谢组学和转录组学分析揭示豇豆豆荚中花青素和其他类黄酮积累的分子机制(国人佳作)
编译:微科盟 伊一,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 豇豆是豆科重要的蔬菜作物,因其豆荚嫩.口感好.营养丰富而被广泛种植.紫色豇豆豆荚吸引了更多的关注,主要是因为它醒目的颜色 ...
-
科研│香港中文大学:正常和闭锁卵泡中猪卵巢颗粒细胞的转录组学分析:类固醇生成和氧化应激的作用(国人佳作)
编译:微科盟 伊安,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 女性不孕的主要原因之一是窦状卵泡闭锁,其潜在的分子机制尚不清楚.因此,研究人员通过ELISA.RNA-Seq.qRT- ...
-
科研│FOOD CHEM(IF:6.306):代谢和转录组联合分析枣树叶芽和成熟叶间代谢产物动态变化(国人佳作)
编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 枣叶具有很高的营养价值和药用价值.然而,对枣叶中的代谢物缺乏全面的动态的评估.本研究采用超高效液相色谱/串联质谱联用技术,对紫色叶芽 ...
-
科研│J AGR FOOD CHEM(一区):代谢组和转录组联合分析解析突变体“胎里红”枣果皮花青素合成机制(国人佳作)
编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 "胎里红"红枣果皮紫红色主要是花青素积累所致,但目前对红枣果实花青素生物合成机制的研究较少.本研究对枣果不同发育 ...
-
科研│ 四川大学:全转录组关联分析发现中性粒细胞发育调控新机制(国人佳作)
编译:刘娟,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 全基因组关联研究(GWAS)发现多个与血细胞性状相关的基因组位点,这些基因位点的生物学相关性有待研究.研究者整合中性粒细胞基因表达和全 ...
-
科研│ INT J MOL SCI: 转录组学分析响应菌核盘菌的候选基因并克隆了桑树核盘菌诱导的几丁质酶基因(国人佳作)
编译:Nicole,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum, Ss)是一种植物病原真菌,可导致油菜的核盘菌茎腐病,并且对桑和许多 ...
-
科研 |MOL METAB:链脲佐菌素模型中胰腺β细胞异质性的单细胞转录组学分析(国人佳作)
编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 目的:链脲佐菌素(STZ)模型广泛应用于糖尿病研究.然而对这个模型中胰腺内分泌细胞和分子状态尚不清楚.本研究对胰岛细胞经STZ处理后的 ...