TCGA多癌种数据分析整合分析 / 开普饭

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

我写了部分常见的TCGA数据库用法: TCGA的28篇教程-免疫全景图 TCGA的28篇教程-指定癌症查看感兴趣基因的表达量 TCGA的28篇教程-对TCGA数据库的任意癌症中任意基因做生存分析 TC ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

我是小助理启帆医学专注于SCI量身定制,SCI免费评估. SCI翻译润色.SCI发表协助:职称/硕博论文写作:科研课题标书设计撰写.如果有需要,您可以随时和我联系~~ 题目:Construction ...

相信绝大多数研究肿瘤的科研工作者的工作都离不开某个特定的基因,现在绝大部分的单基因的生信文章也都有这么一个图,我就随便列举一些文章的Figure1 比如再比如再比如再比如再比如再比如再比如 ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...

这是一份大三学生的课程实践作业~~~ 找出胶质细胞瘤特异性甲基化区域,为临床诊断提供理论依据步骤: 1.查找数据:下载TCGA中GBM的RNA-seq和甲基化数据 2.甲基化数据分析,正常肿瘤对比, ...

大家都喜欢整合多组学数据,实际上目前大多数研究都是拿其中一种组学数据来对样本进行分类,然后查看病人分组后另外一种组学的差异情况.再其次,就是整合多组学数据对样本统一分组. 策略1的案例介绍看到文章 ...

如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析,并不能体会到Seurat的强大,因为Seurat天生为整合而生. 本教程展示的是两个pbmc数据(受刺激组和对照组)整合分析策略,执行整合分析,以便识 ...

大家好,今天要和大家分享的是2021年2月发表的一篇文章:"SLC7A7 is a prognostic biomarker correlated with immune infiltrat ...

临床实践中,尽管有一系列的疗效预判标记物如 PD-L1 表达情况.TMB 等指导免疫药物(Immune-Checkpoint Inhibitors,ICIs)运用,ICIs 单药治疗反应率并不令人满意 ...

默克公司于近日宣布,FDA已经向帕博利珠单抗联合仑伐替尼(可乐组合)治疗晚期肾细胞癌(RCC)和晚期子宫内膜癌的补充新药申请(sNDA)和补充生物制剂许可申请(sBLA)授予优先审查资格.作为肿瘤治疗 ...

诸葛君说:你知道哪些做数据分析的图表?柱状图.饼状图.折线图.散点图,数据分析图表有很多,用excel就可以生成,但是本文我想告诉你的是,通过这些图表该怎么做分析? 常见的6种数据分析图表及应用方式: ...

世界卫生组织大约每 5 年发布一次<世界癌症报告>,根据 2018 年公布的数据,全世界约有 960 万人死于癌症.而且晚期癌症无法用手术切除进行治疗,相对于早期肿瘤患者 91% 的 5 ...

PD-L1表达和肿瘤突变负荷(TMB)已成为免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗反应的重要生物标志物.这些生物标志物在预测不同癌症类型的应答者方面都有成功和失败之处.那么,PD-L1表达与TMB及ICIs ...

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