TCGA数据分析系列(一)
相关推荐
-
科研 | 日本香川大学:MicroRNA-210-3p在乙型肝炎病毒相关的肝细胞癌中的作用
编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肝细胞癌(HCC)是癌症引发死亡的第三个主要疾病,也是全球第五大常见的癌症.尽管肝细胞癌的早期临床治疗已有改观,但是受高复发因素的影响 ...
-
组织芯片的优劣势
组织芯片相对于传统的组织切片优势十分明显,规模大.通量高.标准化,组织芯片上的组织样本实验条件完全一致,有极好的质量控制,同时节省时间.节省试剂更是显而易见.首先,统一实验条件下的组织芯片,可以排除一 ...
-
【接地气小文章推荐二】组织和血浆外泌体中miRNA编辑差异与肺癌发生的相关性
microRNA中的RNA编辑(RNA editing)现象是癌症中的新型生物标志之一.在这项研究中,俄亥俄州立大学的研究人员利用87个NSCLC(非小细胞肺癌)样本的miRNA测序数据来研究RNA编 ...
-
100篇泛癌研究文献解读之病毒感染及整合到肿瘤病人基因里
为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...
-
TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2
所谓工欲善其事,必先利其器,从今天开始,我们来介绍TCGA数据库的使用.今天我们来介绍一款非常容易上手的数库:GEPIA2:http://gepia2.cancer-pku.cn/#index 话不多 ...
-
TCGA数据分析系列(二):UALCAN数据库
UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...
-
TCGA数据分析系列(二):LinkedOmics
今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...
-
TCGA数据分析系列之火山图
前面我们做了TCGA的差异分析,并且用ggplot2验证了差异分析的准确性,TCGA差异分析及ggplot作图验证,而差异分析后一般会又热图和火山图,热图我们之前也有说过热图系列1,R语言学习系列之& ...
-
TCGA数据分析系列 蛋白相互作用网络
我们的TCGA数据分析系列已经出过几期 TCGA数据分析系列(一) TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2 TCGA数据分析系列(二):UALCAN数据库 TCGA数据分析系列(二):Lin ...
-
TCGA数据分析系列 零代码富集分析:ClueGO+CluePedia(1)
前面我们出了一系列的TCGA数据分析教程 TCGA数据分析系列(一) TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2 TCGA数据分析系列(二):UALCAN数据库 TCGA数据分析系列(二):Li ...
-
TCGA数据分析系列:GEPIA2数据库
所谓工欲善其事,必先利其器,从今天开始,我们来介绍TCGA数据库的使用.今天我们来介绍一款非常容易上手的数库:GEPIA2:http://gepia2.cancer-pku.cn/#index 话不多 ...
-
TCGA数据分析系列:LinkedOmics数据库
今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...
-
场地数据分析系列教程-Bison (1)
又是新的一周,制图教室和大家准时相见~ 对于建筑和景观专业的学生而言,场地的数据化分析是设计过程中不可忽略的重要环节,无论是对于地形坡度的分析亦或是对于土方量的估算,乃至地表径流等一系列的模拟,都可以 ...