综合性基因组CRISPR筛选数据库 / 开普饭

癌细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)是一个肿瘤细胞系多组学加上药物作用数据库.网址:https://portals.broadinstitute.o ...

一.CRISPR/Cas9系统的工作原理 CRISPR系统是细菌和古细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御机制,其中以二类CRISPR系统即CRISPR/Cas9最为经典常用.此系统的工作原理是 ...

你翻过自家的 "族谱" 吗?就是那本厚厚的,记载了自己祖辈繁衍和迁徙等信息的书. 癌细胞,也是 "繁衍和迁徙" 的小能手,这可太头疼了,因为癌细胞的一次迁徙,就 ...

肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因,5年生存率约为6%.其中约80%为非小细胞肺癌(NSCLC)组织学类型,手术切除或根治性放化疗提供了最佳的治愈前景.但许多肺癌患者对目前的治疗手段还是存在抵抗心理的, ...

导语环状RNA(circular RNAs, circRNA)是一类由 mRNA 前体经反向可变剪切而来的共价闭合且保守的单链转录本,长度跨度从几十bp到几千bp,在表观遗传及各种细胞过程中发挥重要 ...

数据库介绍 SOURCE是一种统一工具,可动态收集和汇编来自许多科学数据库的数据,从而尝试将来自智人,小家鼠,褐家鼠基因组的基因的遗传学和分子生物学封装成易于导航的GeneReports. SOURC ...

前段时间一个汇总了多个基因组 CRISPR 数据的数据库:[[BioGRID ORCS-CRISPR筛选数据库]].同时之前也介绍了一个肿瘤细胞系相关的 CRISPR 数据库 [[DepMap Por ...

编译:MUSHROOM,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读瘤胃具有特殊的功能,能消化分解植物饲料中复杂的多糖.瘤胃微生物基因组编码可以消化反刍动物日粮中的植物的各种酶类.本研究采 ...

前两天我们对于tRFs的功能同时也推荐了几个关于tRFs的数据库.其中包括tRFs在TCGA当中研究的数据库以及tRFs靶基因预测数据库.这些数据库都是基于分析好的数据来的.但是如果我们有自己的数据, ...

我们在进行研究一个基因之前都要了解这个基因主要是功能是什么,或者它可能的功能是什么.如果要了解一个基因目前的功能的话.可以通过genecards来查找的. 如果想要挖掘这个基因额外的功能的话,那就需要 ...

血管生成是癌症.眼睛和心血管疾病的发展.生理和发病机制的基础.抗血管生成治疗(AAT)抑制异常血管生成已成功应用于临床治疗肿瘤和眼部疾病.然而,对 AAT 的抗性不可避免地发生了,其分子基础仍然知之甚 ...

之前在一篇NC的文献(如何利用公共数据发NC)当中,提到过一个公开的测序数据(MSK-IMPACT).所以今天就来简单的介绍一下这个数据集.这样,在进行公共数据挖掘的时候,除了TCGA.同时也可以考虑 ...

氧气是绝大部分已知生物化学反应所共同使用的底物,其重要性甚至超过ATP及NADH[1].在漫长的进化过程中,光合作用带来的氧浓度上升是地球生态环境改变的重要转折点.氧能促进多种多样的化学反应,同时也能 ...

郭伟龙,中国农业大学副教授,主要以小麦为研究对象,结合基因组学.生物信息学.表观遗传学的手段,开展一系列原创性研究.已开发的DNA甲基化数据比对工具BS-Seeker2和和分析软件包CGmapTool ...

表观基因组动态调节基因表达,并在真核生物的整个生命周期中引导细胞分化. 近年来,以 CRISPR/cas 为基础的表观基因组编辑技术使研究人员能够对内源 DNA 和组蛋白进行特定位点编程的表观遗传修饰 ...

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