Nextflow快速搭建生信分析流程(二)-Tower / 开普饭

■ 西门子计划将 Nextflow Software 的无网格 CFD 技术集成至其Xcelerator 解决方案组合,以快速自动分析具有瞬态流动和运动的复杂应用 ■ 通过此次收购,西门子将CFD ...

本文转载自:机器之心 | 编辑:魔王.小舟端到端关系抽取涉及两个子任务:命名实体识别和关系抽取.近期研究多采用 joint 方式建模两个子任务,而陈丹琦等人新研究提出一种简单高效的 pipel ...

这是我参与更文挑战的第4天,活动详情查看: 更文挑战. 不知道你有没有遇到代码逻辑特别复杂的情况,需要很多的 if else 来判断,每种情况有自己的逻辑.这样的 if else 特别多以后,阅读代码 ...

阅读下列短文,从每题所给的四个选项(A.B.C和D)中选出最佳选项. Would you believe that the tallest bridge in France reaches hig ...

写在前面每个人的时间都是有限的. 昨夜反思,当我发现博士生活已经过了一年半,而我也需要耗费一定量的时间在实验上的时候,我开始有顾虑.我认知中的成长是需要时间的,浮沙筑高楼是不可能持久的. 这类观点 ...

在算法项目落地过程中,如果只考虑机器学习相关部分,个人感觉最花时间的两个部分是数据质量问题处理和模型实验与迭代调优.在之前Fullstack Deep Learning介绍的基础上,我们在这篇文章中主 ...

本节我们介绍Nextflow中的Combine Operators类型.Combine-operators-合并操作符合并操作符包含以下类型:joincrosscollectFilecombineco ...

本节我们介绍Nextflow中的Splitting operator类型.Splitting operators-分割操作符分割操作符用于将channel中的元素分割成不同的块儿,这些块结构将会下游的 ...

本节我们介绍Nextflow中Transforming operators类型.Transforming operators-转换操作符转换操作符包括buffer, collate, collect, ...

本节我们介绍Nextflow中的Operator类型,Operator用户连接不同的Channel或者按照用户指定的规则进行数据的变换操作. Operators分为以下7种类型: Filtering ...

本节我们介绍Nextflow中的Channel类型,Channel是nextflow中process之间进行数据传递的通道. Channel主要有两个属性: 采用异步操作的方式进行数据传递: 数据接收 ...

在前面的两节内容中我们介绍了Nextflow的安装和流程监控平台Nextflow Tower, 大家如果对软件安装还有疑问可以查阅平台中前面两节的内容.这里我们以nextflow的一个具体运行脚本来进 ...

像经常处理生物信息大数据的同学,肯定有自己一套的分析脚本,也就是常说的pipeline了.在我刚开始的时候,也是按照大伙的分析流程,一步一个脚本,后来熟悉了一些,会把经常用到的脚本放在一起,再用变量名 ...

前言众所周知,conda和docker是进行快速软件安装.平台布置的两大神器,通过它们,在终端前敲几个命令.点点鼠标,软件就装好了.出了问题也不会影响到系统配置,能够很轻松的还原和重建. 不过,虽说 ...

导言构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一,对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一. 在进行ngsjs项目时,我做了一张示意图来表示一些高通量测序数据分析项目重现性的要点( ...

Nextflow快速搭建生信分析流程(二)-Tower