conda与bioconda解决生信软件安装困扰 / 开普饭

开篇:2017/10/7正式开始生信技能树论坛里的转录组入门从Linux下软件的安装到差异表达基因的功能注释及功能分析相关. 转录组相关软件的安装任务本地Windows电脑及服务器Linux系 ...

初学者会大量依赖于conda傻瓜式管理软件,在这里首先强推<生信技能树>团队的卖萌哥在2021新年伊始的公开课: https://www.bilibili.com/video/BV1Yy4 ...

bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道,现在已经有超过2700款软件.由于国内没有基镜像,下载安装生物信息软件速度十分缓慢,经常中断,生物信息人迫切需要一个国内镜像.Bioconda ...

什么是Galaxy 很多公司开始推广他们的可视化生信分析工具,有人说未来的趋势是无代码,分析只要拖拖点点就行了.无代码只能说是一个噱头,毕竟人人都会"用"excel,也不是人人都是 ...

本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面什么是Conda? Conda是一款可以帮助我们轻松安装几乎所有的生物信息学软件的工具,说Con ...

清华源.中科大源大部分时间能用,但没事也会被封.最近发现的北外源挺好用.推荐使用: 北外镜像(推荐): conda config --add channels https://mirrors.bfsu ...

最近(2019-05-08 )很多人反映conda镜像挂掉的问题,所以我有必要给粉丝测试一下: wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3- ...

导言来自师妹的投稿,几年前,生物信息数据分析,一个最大的问题即生物信息学软件安装.但现在绝大多数安装问题都可以通过使用conda,一键解决.如果要挑 conda 的毛病,那么就是速度不够快.于是就有 ...

前言生物信息学分析常常需要用到许多不同的软件,常见安装方式有三种: 源码安装,要求安装者对包有较充分的认识,适用于开发者或深入学习和挑战者: 预编译版本安装,一般安装者将其拷贝到目录下即可运行: 第 ...

conda下载miniconda安装miniconda配置镜像创建小环境查看小环境进入小环境查找软件安装软件指定软件安装版本更新软件查看已安装软件退出小环境移除小环境其他注意内容pip安装minico ...

Frontiers in Bioinformatics这本期刊是否值得投纯生信? 江湖再也没有这种接收率达到72%的纯生信友好期刊这个功能可以让很多纯生信SCI被秒拒自己想发多少篇纯生信SCI就发 ...

西门子的软件主要包含,PLC,变频器,人机界面等等.现在的西门子软件可以说已经非常稳定了. PLC系列从西门子S5系列,到西门子200系列的STEP7 MicroWIN,再到西门子300/400系列的 ...

其实我现在已经不写软件教程了! fastqc对原始测序reads质控 NCBI的blast++软件使用说明书 SRA工具sratoolkit把原始测序数据转为fastq格式目录一:下载安装该软件 ...

视频见文末,阅读原文更有惊喜大礼包,希望你听完我的视频,也能制作下面的思维导图!!! 了解并安装R 下载R语言的软件:https://cran.r-project.org/bin/windows/ba ...

全国巡讲的步伐迈入了近20个城市,发现南京站的学员们踊跃分享学习成果,我也很纳闷,是做对的什么才带领了这股风潮呢?以前大家都是蒙头学会了就ok了,这次大家表现的都想要加入生信技能树创作团队! 前些天一 ...

看到群里有人咨询TCGA数据库御用的SNP6.0芯片的CNV数据的分析软件,GISTIC2如何安装和使用.让我想起来五六年前安装它的恐惧,有必要系统性整理一下,并且实名羡慕一下现在的小朋友们,安装软 ...

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