转录组学习一（软件安装）

相关推荐

• 软件介绍之Hisat2

  咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

• conda与bioconda解决生信软件安装困扰

  简介 conda原本是为了解决Python模块安装的依赖问题,然而可能是无心栽柳柳成荫,conda目前已经超越了其最初目的而存在,可以解决大多数软件的安装和配置,包括各种本身与python毫无关系的包 ...

• 宏基因组分析专题（5）：从宏基因组数据中得到高质量的基因组数据- MetaBAT的安装和使用

  生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

• 使用基于python的velocyto软件做RNA速率分析

  单细胞领域的一个高级分析是RNA速率分析,使用velocyto软件可以做,我们同样的把它区分为上下游分析. 上游分析需要在Linux操作环境里面,前面对10x的测序数据fq文件完成了 cellrang ...

• 2021第二期_生信入门班_微信群答疑整理

  做教学我们是认真的,如果你对我们的马拉松授课(直播一个月互动教学)有疑问,可以看完我们从2000多个提问互动交流里面精选的200个问答! 与十万人一起学生信,你值得拥有下面的学习班: 生信入门课-20 ...

• 看优秀本科生如何一周内学会Linux进而搞定RNA-seq上游分析

  距离公布要带500个优秀本科生入门生物信息学的活动不到一个月,虽然真正入选不到一百,但是培养成绩喜人,出勤率接近百分之百,大部分人在短短两个星期就完成了R基础知识学习,Linux认知,甚至看完了转录组 ...

• 单细胞基因组拷贝数变异流程

  主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的  http://www ...

• 居然还可以这样欺骗软件

  我们的马拉松生物信息学入门课程进入到Linux实战环节,给大家都提供了一个云服务器账号,这样全部的学员都可以登录到我们的服务器里面方便沟通和交流.授课进行到conda安装和管理生物信息学软件,首先在自 ...

• 最新最全的varscan 软件找somatic mutation

  我在生信技能树发布的很多关于varscan 软件找somatic mutation教程都过时了,如下: TCGA计划的4个找somatic mutation的软件使用体验 肿瘤全外显子测序数据分析流程 ...

• 1 wes相关软件下载与安装并添加环境变量

  1 wes相关软件下载与安装并添加环境变量

• 我们的目标是星辰大海-Galaxy云平台

  什么是Galaxy 很多公司开始推广他们的可视化生信分析工具,有人说未来的趋势是无代码,分析只要拖拖点点就行了.无代码只能说是一个噱头,毕竟人人都会"用"excel,也不是人人都是 ...

• 零基础教程 | 叶绿体基因组组装 - GetOrganelle

  关键词:零基础:叶绿体基因组:神器:国人佳作:一键成环. 软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle GetOrganelle 这款软件是建军和郁文彬老 ...

• 宏基因组分析专题（2）：生物信息学软件的应用市场-Conda的安装流程

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面 什么是Conda? Conda是一款可以帮助我们轻松安装几乎所有的生物信息学软件的工具,说Con ...