宏基因组分析专题（5）：从宏基因组数据中得到高质量的基因组数据- MetaBAT的安装和使用 / 开普饭

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

最为生物信息学痴的我当然不能错过,今天终于找到了空隙时间来体验一把! 全部体验报告如下: 起初我是在windows安装这个的,因为是浏览器而已嘛下载jbrowse最新版解压,然后setup,但是lo ...

Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接:harvardinformatics/ATAC-seq 参考文献:ATAC-seq: A Method ...

随着宏病毒研究的日益火热,许多小伙伴都在想自己曾经测过的宏基因组数据能否再深挖一波?当然可以!前面几期小编给大家抛砖引玉介绍了组装软件以及病毒数据库的基本知识,这期我们就来聊一聊,如果不依赖于数据库的 ...

主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的 http://www ...

[TOC] 写在前面这是对宏基因组提取扩增子序列16S分析的第二部分,这部分将核糖体RNA基因组装后进行分析.上一节我们使用了 bbmap提取了核糖体序列,但是单纯用于ASV的方法聚类是不行的,以为 ...

文章结合DAMA数据治理模型以及国家卫生健康委员会制定的<国家健康医疗大数据标准.安全和服务管理办法(试行)>,分析了当前医疗数据治理的核心痛点和应对之策,给行业相关工作者提供了系统有益的 ...

本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众号. 写在前面为什么要质控? 宏基因组测序一般用的是illum ...

本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众号. 在上一节"宏基因组分析专题(3):宏基因组数据的质控 ...

本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面什么是宏基因组测序以及分析? 简单来说就是提取我们样品中总DNA并进行二代测序,测序后需要对测序 ...

本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面什么是Conda? Conda是一款可以帮助我们轻松安装几乎所有的生物信息学软件的工具,说Con ...

IT之家 5 月 13 日消息据中国科学院网站,中国科学院近代物理研究所科研人员近日从实验数据中提取出质子质量半径值,相关研究成果以快报形式发表在 Physical Review D 上. 据介绍, ...

羊作为人类最早期的驯化动物之一,在畜牧业中举足轻重. 近日,中国团队和美国国家生物技术信息中心(NCBI)携手合作,先后发布了西藏绵羊高质量参考基因组和东佛里生绵羊高质量参考基因组.这对于完善绵羊种质 ...

前文回顾欧美流行乐.古典乐爱好者的福利 Apple Music 提起国内的音乐流媒体平台,Apple Music总是习惯性被忽略,好像大家都不把当回事一般.确实,比起QQ音乐.网易云音乐一众本土平台 ...

前文回顾国外高质量影视资源推荐众所周知,YouTube.Netflix.Amazon Prime Video等视频流媒体平台未能进入内陆市场,再加上爱奇艺.腾讯视频.优酷.芒果TV等几大国内视频网 ...

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