单细胞基因组拷贝数变异流程 / 开普饭

写在前面最近主要忙一些植物群体基因组数据的项目.前面提过,赶时间,全基因组的 SNP Calling 使用 GATK 流程,还是需要跑上两三天.但这个还是耗时,并不一定能够赶上工期.于是我将目标转移 ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接:harvardinformatics/ATAC-seq 参考文献:ATAC-seq: A Method ...

作为国内遗传病基因诊断领域的领先者,凯昂医学通过其自主研发的聚合检测技术为5000多例患者提供了诊断服务,其中不乏让公司团队印象深刻的案例: 一名7月龄患儿因"癫痫反复发作"就诊, ...

单细胞全基因组测序 (Single-cell whole-genome sequencing,scWGS) 已成为揭示生物样本中细胞间异质性.识别基因组变化 (如拷贝数变异.点突变) 的有力工具.该技 ...

inferCNV用与探索肿瘤单细胞RNA-seq数据,分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy number alterations, CNA), 例如整条染色体或大片段染色体的增加或丢失( ...

来源:北大医院 2021-09-15 07:12胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果.在题为"Sing ...

编译:怀瑾,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读转录组分析是研究肝功能,肝病过程中基因表达变化,鉴定预后标志或特征以及发现新治疗靶标的重要方法.单细胞RNA测序(scRNA-seq ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 马克斯普朗克进化人类学研究所(Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology)Sa ...

以色列魏兹曼科学研究所eran Segal等人于2019年3月27日在<Nature>上发表题目为<Structural variation in the gut microbiom ...

宏基因组中挖掘原核基因组的分析流程从宿主相关的短读长鸟枪宏基因组测序数据中恢复原核基因组 Recovering prokaryotic genomes from host-associated, s ...

人类基因组由23对染色体中的60亿个碱基(或核苷酸)组成. 正常人类基因组成分通常是以2个拷贝存在,分别来自父母. 拷贝数变异(CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段 ...

单细胞基因组拷贝数变异流程