使用inferCNV分析单细胞转录组中拷贝数变异 / 开普饭

写在前面早晨,一个老朋友(也是 TBtools 的老用户)与我联系,大体是问了我一个事情gbff转gff3是否可以用TBtools?答案当然是可以,但我不建议.主要原因有二: 使用gbff,往往是基 ...

免疫逃避机体的免疫可以通过各种各样的方法抵御各种各样病原体的入侵,但是,病原体也可以通过各种手段来逃避免疫系统的攻击和追杀,实现它在机体内存活并伺机扩散的目的,也就是免疫逃避. 摘要 PD-L1和P ...

了解我的应该都知道我最近几个月都在奋战一个陌生的领域,单细胞转录组数据处理.真的很有挑战性,笔记累积了一大堆了,但是没有太值得分享的,大多是利用bulk转录组数据处理的经验而已,但是下面这个是单细胞转 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 使用AUCell识别单细胞rna数据中具有活性&q ...

编译:刘娟,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本文采用单细胞RNA-seq,分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者肿瘤组织样本, ...

编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:链脲佐菌素(STZ)模型广泛应用于糖尿病研究.然而对这个模型中胰腺内分泌细胞和分子状态尚不清楚.本研究对胰岛细胞经STZ处理后的 ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读霍奇金淋巴瘤(HL)的特点是该肿瘤微环境(TME)主要由不同类型非癌性免疫细胞和罕见的恶性细胞所主导.细胞成分及其空间关系的表征对 ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 清华大学.北大三院.广州再生医学与健康广东省实验室马普中心等单位付卫.杨雪瑞和陈晔光等人于2019年11月21日在医学国际权威期刊Jou ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了一半broad开发的inferCNV软件,但是只运行了其测试数据,远远不够.单细胞转录组数据分析CNV使用broad出品的i ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了broad开发的inferCNV软件,在其提供的测试数据上面成功运行了,也测试了airway这个转录组数据,但是效果不好,现 ...

文章信息文章题目:Single-cell Transcriptome Profiling reveals Dermal and Epithelial cell fate decisions duri ...

使用inferCNV分析单细胞转录组中拷贝数变异