转录组学习五（reads比对） / 开普饭

距离公布要带500个优秀本科生入门生物信息学的活动不到一个月,虽然真正入选不到一百,但是培养成绩喜人,出勤率接近百分之百,大部分人在短短两个星期就完成了R基础知识学习,Linux认知,甚至看完了转录组 ...

怕什么报错呢,重来一次不就好了吗! 学员群有人提问,他们上完了我们的转录组课程,自己拿服务器去跑一个文献数据,有一个样本的sam转为bam文件报错,得到文件如下: 213M 2月 20 20:59 ...

主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的 http://www ...

最近有粉丝在我们<生信技能树>公众号后台付费求助,想重新分析一下他自己领域的一个文章的转录组测序数据.因为那个文章并没有提供表达量矩阵,不过万幸的是人家上传了原始测序数据. 因为他的课题是 ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

下面是MeRIP-seq 图表复现笔记在上一期中我们得到hisat2的比对结果,见:m6A图文复现03-测序数据去除rRNA序列并且比对到参考基因组现在一起来看下比对情况,并且进行一些常规的可视化 ...

希望所有学员都可以站在生信技能树的舞台上发光发热! 下面是2020生信入门班学员的随机投稿因为平时做单细胞比较多..突然想试试自己还会不会常规转录组的上游分析..记忆一下各个软件的使用流程也是不错的 ...

Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接:harvardinformatics/ATAC-seq 参考文献:ATAC-seq: A Method ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

任务学习了解各个reads计数,及标准化的原理,如RPKM/FPKM/TPM的统计学原理: 了解reads计数的各个软件,用入门的htseq-count软件对每个样本内生成关于表达量的文件: 用脚本 ...

纯干货|高效时间管理自律学习五大方法总是觉得时间不够用?你需要好好规划一下了.分享给你5个简单好用的学习法,祝你逆袭![钱] 1⃣️番茄工作法✅ 2⃣️四象限法则✅ 3⃣️莫法特休息法✅ 4⃣️S ...

时间管理如何保持在职一天高效学习五小时当我们做一件事情有阻力时我们就会减少去做的可能性做一件事动力大于阻力就能实现自律因此,如何提升动力降低阻力是实现自我管理与精进的核心

很喜欢看<知否>,因为喜欢看明兰一路升级打怪不断升级,好像看着她自己也有了无限的动力,在面对困难的时候可以更加有勇气和底气. 自小不被人疼爱的盛明兰,其实是个非常聪明的女孩,从她那么小就擅 ...

庆余阁自一开始五运六气培训与研究以来,就有很多人一直问,五运六气会很难的,我学不会.没有基础是不是就不能学了?基础班我就不学了,这些概念一直存在一定程度的误区,所以很多人看到五运六气就开始头痛,就开始 ...

学习"五项管理" 重视学生成长 2021年6月2日,车辆小学全体师生齐聚操场,共同学习"教育部关于作业.睡眠.手机.读物.体质等五项管理文件汇编"的相关内容. ...

1.你是假学习还是真学习? 这里很多人就会好奇了,学习还有假的学习吗?怎么可能有假的学习,时间我花了,钱我也交了作业我也做了,是的这些你都做了,但是你的结果是什么啊!如果你学了很多东西你一个结果都没 ...

("龙砂医学"庚子年渭南学习班笔记) 中华民族伟大复兴的落脚点是什么? "阴阳五行"为什么是中国公民科学素质基准? 太极图竟是天然时钟?阴阳究竟是什么? 什么是 ...

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