明码标价之普通转录组上游分析
相关推荐
-
宏基因组分析专题(5):从宏基因组数据中得到高质量的基因组数据- MetaBAT的安装和使用
生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...
-
踩坑日志 | kingfisher 公共测序数据 SRA/Fastq 下载神器!
导言 前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...
-
明码标价之单细胞转录组的质控降维聚类分群和生物学注释
一般来说,公共数据集都会给出表达量矩阵和具体不同细胞亚群特异性基因,比如 GSE122083 数据集背后的文献,就给出来了这些分群: NK (NKG7 and GNLY), NKT (CD3D and ...
-
明码标价之10X转录组原始测序数据的cellranger流程
冷知识:其实一个10X单细胞转录组样品可以有多达84个fastq文件哦! 我们在单细胞天地多次分享过cellranger流程的笔记,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一)数据下载 单细胞实战( ...
-
单细胞转录组上游分析之shell回顾
课程笔记 目录 单细胞转录组学习笔记-1 单细胞转录组学习笔记-2 前言 目前主流的单细胞测序技术主要有两种:主打基因数量的smart-seq2和主打细胞数量的10X Genomics.单细胞转录组分 ...
-
转录组上游分析错误(报错大赏)
希望所有学员都可以站在生信技能树的舞台上发光发热! 下面是2020生信入门班学员的随机投稿 因为平时做单细胞比较多..突然想试试自己还会不会常规转录组的上游分析..记忆一下各个软件的使用流程也是不错的 ...
-
明码标价之转录组下游分析
们可以做全部的分析,只需要你能明确好你的需求,而且付得起费用,十万工程师嗷嗷待哺呢!恰好我们去年投稿了<侠之大者,为老数据接盘>的老铁又一次来稿: 下面是投稿 RNA-seq新赛季,DEG ...
-
明码标价之公共数据库的生存分析
最近有粉丝在我们<生信技能树>公众号后台付费求助,想follow一个文章看两个基因组合起来在一个数据集的生存分析. 因为她的课题是保密的,我这里不方便提基因名字和数据集,就show她想fo ...
-
明码标价之转录组测序数据的可变剪切
前面我们的明码标价之普通转录组上游分析,受到了各大热心粉丝的吐槽,觉得太简单了我们居然还好意思收费. 额,其实呢,这些粉丝应该是"饱汉不知饿汉饥",其实数据分析这个技能啊,难者不会 ...
-
明码标价之转录组常规测序服务
前面我们开通了明码标价专栏: 都是公共数据的处理,其实也同步给了全部的代码,也算是一种粉丝福利吧!因为我们一直在面向数据的教程服务,确实没有自己的实验室没有自己的测序仪,所以对很多粉丝的测序要求只能说 ...
-
明码标价之RNA-Seq数据的内含子保留分析
前面我们的明码标价之普通转录组上游分析,受到了各大热心粉丝的吐槽,觉得太简单了我们居然还好意思收费.后面我就就加上了稍微有一点难度的<可变剪切>,不过仍然是阻挡不了粉丝无穷无尽的需求,后台 ...