JASPAR：转录因子motif数据库 / 开普饭

TFcancer: a manually curated database of transcription factors associated with human cancer 网址:http: ...

一文学会footprintDB数据库使用方法嗨,小伙伴们大家好!这里是每周一弘毅专栏,我志向用小小文字助力你的SCI发表之路.本周继续转录因子话题,给大家带来转录因子综合数据库footprintDB ...

做完转录组分析完之后,一般会找到一些差异表达的基因.差异表达基因中如果有转录因子的话,可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达.要预测转录因子调控的靶基因,需要两个步骤: 1. 首先需要知道转录因子的结 ...

本期直播主题: 如何半小时搞定一篇医学文献? 点击预约按钮,领开播好礼! 解螺旋公众号·陪伴你科研的第2693天翻牌啦! 我们之前在介绍肿瘤表观遗传相关数据库MR4Cancer(http://cis ...

AnimalTFDB 3.0使用教程各位亲爱的小伙伴们大家好~今天我们继续来聊一聊转录因子的故事.有关转录因子的数据库之前弘毅老师给大家介绍过很多,其中就有大名鼎鼎的JASPAR数据库,上周我也安利 ...

很多转录因子预测的数据库是基于转录因子的Chip-seq的数据来进行构建的,这样的结果能说明某一个转录因子结合某一段序列,但是结合并不一定说明可能影响这个基因的表达(高通量测序技术极简介绍),所以最好 ...

在特定的细胞或组织中,发挥作用的转录因子在调控网络中的地位也是不同的.来自胚胎干细胞和其他细胞模型的研究表明,一小组细胞类型特异性或谱系特异性转录因子(TFs)形成了相互连接的自动调节环,以控制特定细 ...

转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战.已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)和靶基因之间的调控相互作用,TRRUST是迄今为止,最大的可公开免费获得的人类TF-靶 ...

miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用.据报道,miRNA的异常调控与多种疾病的发生和发展有关,包括癌症,心血管疾病等.但是潜在的机制仍然难以明确,部分原因是转录因 ...

HOCOMOCO是专门研究人和小鼠的数据库,团队从超过5000个针对人类和小鼠转录因子的实验中获得的14000多套ChIP-Seq数据集,基于系统化的基序发现和交叉验证,展示了人类和小鼠转录因子结合模 ...

转录因子(TFs)可以通过结合其启动子或增强子的特定DNA序列来调节靶基因的表达.鉴定人中的TF-靶标调控是了解生物学过程(包括发育和发病机制)基础的分子调控机制的基础,而不同条件下的转录因子靶基因的 ...

转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因.探索转录因子功能的最重要策略之一. ...

一个转录因子能同时控制多个基因的表达,同时转录因子的功能作用也可能受多个调控因子的影响.Cistrome DB就是这样的一个数据库,可以展示转录因子的相关调控内容. Cistrome DB历年样本数据 ...

JASPAR：转录因子motif数据库