TRRUST：转录因子调控网络专用数据库 / 开普饭

五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记一. ...

前言整理这个专题的缘由,是在朋友圈看到的求助信息.于是我想把我之前了解或者是做过的一些东西整理一下. Q1: 哪个TF(转录因子)调控了我的基因集? 假设你有一个genelist: Gene1 Ge ...

编译:Nicole,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读基因表达的调控是生物学过程的核心部分.基因调控网络(GRNs)将转录因子(TFs)与其靶基因连接起来,代表了潜在的转录调控图谱 ...

基因转录的过程当中,基因由DNA转录成mRNA的过程受到很多因素的调控.其中就包括了转录因子的调控.转录因子调控的一个主要的过程是转录因子和基因启动子区进行结合进而来对其表达进行调控.由于每个转录因子 ...

我们之前做转录因子调控预测的时候,通常都是基于单一基因来做的,随着测序技术的成熟,我们在做完组学数据分析的时候,经常可以得到很多的基因.如果我们要寻找这么多基因共同转录因子的话,要怎么办呢?这次介绍的 ...

miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用.据报道,miRNA的异常调控与多种疾病的发生和发展有关,包括癌症,心血管疾病等.但是潜在的机制仍然难以明确,部分原因是转录因 ...

编译:Yong-qin,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读氮(N)是决定植物光合作用和生产力的重要因素.目前氮肥广泛应用于农业领域,但过量的氮肥易产生挥发性氮氧化物和硝酸盐离子而 ...

一个转录因子能同时控制多个基因的表达,同时转录因子的功能作用也可能受多个调控因子的影响.Cistrome DB就是这样的一个数据库,可以展示转录因子的相关调控内容. Cistrome DB历年样本数据 ...

▼ 衰老是植物在长期进化和自然选择过程中形成的一种不可避免的生物学现象,也是植物生命科学研究的核心问题之一.叶片衰老是叶片发育的最终阶段,是程序性细胞死亡(PCD)的一种表现形式.衰老过程中叶片同化 ...

编译:六单元,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在部分冷血脊椎动物中,损伤会引起视网膜米勒神经胶质细胞再生成为神经元从而实现对视网膜损伤的修复,但遗憾的是,在哺乳动物中几乎不存在这 ...

编译:YQ,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物根系对于生长发育至关重要,根系吸收养分和水,同时防御土壤微生物.在不断变化的环境压力下,根系进化出复杂的结构,包括不同功能的细胞类 ...

编译:Yong-qin,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读物种的遗传变异包括插入/缺失变异(PAV).拷贝数变异(CNV)等,在农作物性状的遗传特性中起重要作用,而泛基因组是研究 ...

TRRUST：转录因子调控网络专用数据库