基于单细胞测序的转录因子调控网络预测数据库 / 开普饭

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

在特定的细胞或组织中,发挥作用的转录因子在调控网络中的地位也是不同的.来自胚胎干细胞和其他细胞模型的研究表明,一小组细胞类型特异性或谱系特异性转录因子(TFs)形成了相互连接的自动调节环,以控制特定细 ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读洛桑联邦理工大学[École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)]的Gioele ...

miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用.据报道,miRNA的异常调控与多种疾病的发生和发展有关,包括癌症,心血管疾病等.但是潜在的机制仍然难以明确,部分原因是转录因 ...

一个转录因子能同时控制多个基因的表达,同时转录因子的功能作用也可能受多个调控因子的影响.Cistrome DB就是这样的一个数据库,可以展示转录因子的相关调控内容. Cistrome DB历年样本数据 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

我们之前做转录因子调控预测的时候,通常都是基于单一基因来做的,随着测序技术的成熟,我们在做完组学数据分析的时候,经常可以得到很多的基因.如果我们要寻找这么多基因共同转录因子的话,要怎么办呢?这次介绍的 ...

转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战.已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)和靶基因之间的调控相互作用,TRRUST是迄今为止,最大的可公开免费获得的人类TF-靶 ...

前两日双星陨落,我国一天痛失两位院士.一位是让中国人吃饱的"杂交水稻之父"袁隆平,一位是"中国肝胆外科之父"吴孟超.吴老曾以1960年至1977年间切除治疗原发 ...

多年生木本作物茶树具有重要的经济和文化价值,其基因组庞大(约3Gb),杂合度高,且自交不亲和.单体型一般是指在同一条染色体上共同遗传的多个等位基因的组合,其在填补缺失基因型数据.研究重组交换模式以及追 ...

编译:Yong-qin,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读氮(N)是决定植物光合作用和生产力的重要因素.目前氮肥广泛应用于农业领域,但过量的氮肥易产生挥发性氮氧化物和硝酸盐离子而 ...

编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 衰老会导致全身组织功能下降,由于限制热量(CR)可能会延缓该过程.然而细胞形态和衰老特征,以及CR改善的细胞形态和特征目前仍不清楚.本研究 ...

高通量单细胞测序是指从单个细胞的水平上对成千上万个细胞中的遗传物质进行测序,从而识别样本中的细胞的类型.功能,特定细胞健康或状态的变化.单细胞测序不仅能够分析相同类型细胞的异质性,还能获取珍贵的临床样 ...

前言今天和大家分享的是2020年12月份发表在Molecular Therapy杂志上的一篇文章(IF=7.031)"Single-cell RNA-seq dissects the in ...

基于单细胞测序的转录因子调控网络预测数据库