如何优化一个传统分析方法还发了14分 / 开普饭

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

转眼间一年时间过去了,我们的全网第一个单细胞基础视频课程也结束了,还有点依依不舍. 不知道大家学的怎么样,我这边看起来线下学徒和实习生都学的挺好的,还有详细的笔记分享,考虑到大部分人是没有机会线下接受 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. ATAC-seq 技术简介 sc-ATAC-seq ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 文章信息 Luecken MD, Theis FJ ...

文章信息文献标题:The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq 发表时间:2020.06.21 发表杂志:N ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

最近,bioconductor团队出版了一本电子书,其整合了其网站上关于单细胞的R包并制定了一套常规的分析流程包括分析,可视化,导入导出.不仅如此,前三章还分别教你如何下载使用R,使用biocondu ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

大家好,我是风.欢迎来到风风的从零开始单细胞系列.前面我们已经学习了数据下载.构建分析对象和数据质控.如果你的scater出现了一些警告内容,提示函数被替代,那也不用着急.正如其他内容一样,scate ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵差异分析前的准备工作 scRNA-seq--读入数据详解 scRNA-seq--质量控制为什么需要Norm ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵差异分析前的准本工作学习目标了解如何导入单细胞rna-seq实验的数据. 质量控制流程在量化基因表达 ...

实体瘤肿瘤特异性免疫预后特征及其与免疫检查点治疗的关系首先让我们通过摘要了解下这篇文章的主要内容,为了阐明免疫细胞浸润作为实体肿瘤预后标志的作用,作者分析了四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和TC ...

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单细胞转录组下游的降维聚类分群这样的基础操作相信大家应该是都没有问题了,参考前面的例子:人人都能学会的单细胞聚类分群注释 ,只需要你有一个基于基因的表达量矩阵的分析. 对转录组数据(包括单细胞转录组 ...

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