又一个TCGA可变剪切分析利器 / 开普饭

每月一生信流程栏目灵感来自于<铁汉1991>博客的<每日一生信>,他那个时候介绍的主要是生信基础知识,包括数据结构,数据格式,数据库资源,计算机基础等等,所以每天都可以进步,每 ...

以后只用Rmarkdown写博客啦! 如果你想知道这样的图如何做出来了: 请直接点击下面的阅读原文阅读,省掉了图文排版时间,赞~ http://www.bio-info-trainee.com/bio ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

我最近看到了一个综述,在讨论 TNFSF15 基因 ,亦称TL1A或VEGI(血管内皮细胞生长抑制因子),为肿瘤坏死因子超家族成员之一. TNFSF15在染色体上的位置是9q32,包含4个外显子区域, ...

编译:微科盟 Nicole,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读拟南芥的昼夜节律控制着许多生理和分子过程,使植物能够预测其环境的每日变化.然而,mRNA水平变化如何与共转录/转 ...

MA Anderson御用软件SpliceSeq已经是发表于2012的文章了:<SpliceSeq: a resource for analysis and visualization of R ...

可变剪切(Alternative splicing,AS)是基因转录时,通过组合不同的外显子,形成不同转录本的过程,在生命的信息传递过程中发挥着重要的作用,维持蛋白质多样性的主要机制.在不同组织或者发 ...

关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...

了解我的应该都知道我最近几个月都在奋战一个陌生的领域,单细胞转录组数据处理.真的很有挑战性,笔记累积了一大堆了,但是没有太值得分享的,大多是利用bulk转录组数据处理的经验而已,但是下面这个是单细胞转 ...

featureCounts我们粉丝都耳熟能详了,我们转录组流程介绍的对比对后的bam文件基于基因注释文件定量的首选软件,用法非常简单,关键是速度飞快,吊打htseq-counts几条街,而用DEXSe ...

HBV是目前已知的感染人的最小DNA病毒,其基因组大小约为3.2 kb,包含4个高度重叠的开放阅读框(ORFs).除了这些经典的ORFs外,越来越多的证据表明,HBV还通过可变剪切形成了许多额外的OR ...

导读分析是一门科学,是模糊的明确化,每一级别的分析都是严谨的剖析,级别越小,可剖析的细节越多,相对就越复杂,同时可容忍的犯错空间越小. 操作是一门手艺,是明确的模糊化,每一级别的操作都是市场的共舞 ...

又一个TCGA可变剪切分析利器