公共数据库基础生信分析汇总贴 / 开普饭

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2526天零代码复现二区期刊本次给大家零代码复现一篇2021年发表于Gland Surgery的中科院二区期刊,影响因子2.19分. 文章题目 Identificati ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2541天零代码复现非肿瘤文章大家好,我是濤濤.众所周知,仙桃生信工具www.xiantao.love一直致力于协助大家在进行生信研究提供便利性.最近,仙桃生信工具又推 ...

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear ...

推荐两个可以进行GEO临床数据下载的网址乔治敦癌症数据库(G-DOC)(https://gdoc.georgetown.edu/gdoc/),G-DOC是一个精准医学平台,其中包含来自一万多个患者和 ...

一提到数据挖掘,可能大家都会想到肿瘤数据挖掘,而是忽略非肿瘤的方向.今天,我们就给大家介绍一下非肿瘤方向的数据挖掘.作者是日本人,研究是的慢性牙周炎,也就是口腔科,文章发表在BMC Oral Heal ...

最近一直沉迷于一个岛上生活的游戏,突然发现岛上求生的日子,其实和最近很多的利用公共数据库来挖掘生信文章很相似.因此也就像就着这个游戏来聊一下最基本的这类文章的分析思路.之后也就给大家来稍微的讲讲简单的 ...

怎样才能不做实验,不用R语言,还能发3分+SCI? 今天介绍几个可以用得上的数据库,只利用数据库中的数据进行分析,甚至不用R,利用在线分析工具,敲敲电脑就能解决急需发文章,没时间做实验,没有科研经费的 ...

什么是生信?提起生信,相信大家又爱又恨,得不到的永远在骚动.爱是不用做实验就能发原创研究,好棒啊.恨是看不懂那一大串代码,不会操作. 目前,不做实验发文章的主要有两大类:Meta分析,生信.其中生信文 ...

万能公式登场 A基因 (RNA/蛋白) ↓ X疾病的B通路 ↓ C功能那么大致的方向有哪些呢??????? 1. A, B和C水平和生存,临床分期等的关系 B/C如果不是单个水平的基因(比如说是某个 ...

为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理(PLUS).建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt ...

本节我们介绍Nextflow中的Combine Operators类型.Combine-operators-合并操作符合并操作符包含以下类型:joincrosscollectFilecombineco ...

目前,单细胞技术主要用于科研市场,其在国内科研服务市场的规模已连续多年成倍增长.单细胞技术在临床市场的前景更为广阔,然而,在进入临床上还面临着一些挑战,其中如何打造覆盖单细胞捕获.测序及生信分析全流程 ...

本节我们介绍Nextflow中的Splitting operator类型.Splitting operators-分割操作符分割操作符用于将channel中的元素分割成不同的块儿,这些块结构将会下游的 ...

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