TCGA
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学一学DNA甲基化芯片分析流程
今天是生信星球陪你的第778天 大神一句话,菜鸟跑半年.我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手 ...
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表观遗传学(Epigenetics)
表观遗传学的概念基于遗传学而来,不是单纯的体外在环境导致的甲基化和乙酰基化改变,也不是简单转录因子和miRNA等等基因调控,它的指的是由非DNA变异而改变表型的'可遗传的'现象.现在众多所谓的表观遗传 ...
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全基因DNA甲基化检测“金标准”--- 改进版简化基因组甲基化测序
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Cell：下一代基因编辑技术CRISPRoff，开启表观遗传编辑时代
以CRISPR/Cas9系统为代表的基因组编辑工具在发挥功能时需要改变DNA序列,往往面临着脱靶导致的安全性问题. 越来越多的研究证明,在病毒感染和癌症中,表观基因组发挥着核心作用.表观遗传通过D ...
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基因甲基化研究实验技术服务
DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鸟嘌呤(7-mG).DNA的甲基化可引起基因的失活,可引起染色质结构.DNA构象.DNA稳定性及DNA与蛋 ...
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什么是DNA甲基化？
近几年DNA甲基化经常被人提及,但很多人对它并不是很了解,那么到底什么是DNA甲基化,它又有什么作用呢,请看敬善基因为您介绍! DNA 化学修饰为 DNA 序列编码基因的表达增加了一层调控机制.这些化 ...
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TCGA临床信息中英文对照
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基于TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析流程
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癌症类型和样本代号详解TCGA
这是实战TCGA数据库的又一个知识点,如果你已经对TCGA有浅显的认识,那么我们应该根据研究方向找到自己的癌症类型,TCGA有一台完整的癌症分型,慢慢这个分型也成为了主流,你别不服气,如果我们有这样的 ...
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TCGA+biomarker
引用:Clariom; https://www.jianshu.com/p/8b257d1ff818生存分析KM法与Cox法异同KM 方法即Kaplan-Meier survival estimat ...
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整理从TCGA下载的数据
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生信分析零基础——从GEO到TCGA，让你从「门外汉」到「老司机」
什么是生信?提起生信,相信大家又爱又恨,得不到的永远在骚动.爱是不用做实验就能发原创研究,好棒啊.恨是看不懂那一大串代码,不会操作. 目前,不做实验发文章的主要有两大类:Meta分析,生信.其中生信文 ...
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TCGA / 癌症简称 / 缩写 / TCGA癌症中英文对照
TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称 Cohort 英文名称 中文名称 ACC Adrenocortical carcinoma 肾上腺皮质癌 BLCA Bladder Urothelial ...
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TCGA免疫浸润评价数据库
免疫浸润评估大致过程 对于RNA-seq的数据,之前我们的分析方法只是局限于单个基因之间的整合分析,最多也就是做一下富集这样的聚类分析.前段时间随着肿瘤免疫的热度,也有人试着开始利用RNA-seq这样 ...