微生物生态-代谢组分析最难安装的四个R包（Ubuntu） / 开普饭

再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: <生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)& ...

单细胞转录组测序很热,想必很多人都想学习一下.因为大家都喜欢热点,热点好搞基金,更好发文章,这是科研圈的共识.既然这么热,我们就从安装R包开始.这些包还是挺多的,包安装不好,后面的分析就没有办法做了呀 ...

R到3.5因为引入了Bioconductor version: Release (3.8),是一个破天荒地的改变,必须更新! Ubuntu倒是很稳定,现在其实已经是Ubuntu18了. deb ht ...

不得不说,现在各种软件系统的版本更新都好迅速! 一般来说,新安装的ubuntu系统都太干净,缺很多库文件,下面的代码先运行一波! sudo apt install --fix-missing libc ...

生信第一步-购买腾讯云服务器搭建自己的生信分析环境由于R,Rstudio,Shiny都已经安装好了,那么我就直接进入服务器,进行安装.人在墙外,因此无需设置cran repos和Bioc_mirro ...

" 也许那是过去的你,你无法改变,但现在的你能够变得强大." --科白君 "R实战"专题·第2篇编辑 | 科白维尼 4445字 | 7分钟阅读本 ...

推荐:江舜尧编译:青玫编辑:马莉西班牙外泌体实验室Marc Clos-Garcia等于2019年7月18日在<EBioMedicine>发表题目为<Gut microbiome ...

编译:小鹿同学,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读番茄(Solanum lycopersicum)是世界范围内主要的园艺作物,已成为代谢研究的理想模型.尽管许多研究工作都集中于分 ...

编译:北越城主,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在大多数散发性结直肠癌病例中,肿瘤发生是一个多步骤过程,涉及基因组改变和形态学改变.越来越多的证据表明人类肠道微生物组与大肠癌 ...

编译:秦时明月,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读水稻是人类重要的食物和营养来源.尽管科学家们已经在植物代谢组学方面取得了进展,但对水稻籽粒不同发育时期代谢物的遗传和分子机制的了解 ...

小太阳编译:小太阳,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读结肠部位的微生物群落可调控众多营养物质复杂的化学转化过程并释放出具有不同生物学效应的代谢产物.但目前对结肠内部纵向代谢动力 ...

推荐:江舜尧编译:番茄加牛腩同学编辑:小菌菌上海交大附属第六人民医院贾伟.赵爱华和上海中医药大学李后开团队于2019年10月31日在Nature Communications发表题目为<T ...

本文由George编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读高达四分之一非酒精性脂肪肝患者(NAFLD)会发展出进行性肝炎,称为非酒精性脂肪肝炎(NASH),可能会进一步发展为肝硬化 ...

冬季的冷冻胁迫是中纬度和高纬度地区茶树生存的最大障碍,每年对茶树的产量.质量甚至寿命都有很大影响.本研究利用转录组和代谢组来阐明60年生自然越冬茶树在冷胁迫下的抗冻机制.接下来,获得了 3880 个 ...

本文由周宇航编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读有关啮齿动物的研究已经证实了肠道中定植的微生物会影响神经发育.特别是,改变肠道微生物群会影响探索和交流行为以及认知表现.但是在人 ...

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