Bioconductor的质谱蛋白组学数据分析 / 开普饭

" 也许那是过去的你,你无法改变,但现在的你能够变得强大." --科白君 "R实战"专题·第2篇编辑 | 科白维尼 4445字 | 7分钟阅读本 ...

一.R包的安装 0. 设置镜像 R和bioconductor的主服务器都在国外,设置镜像加快下载速度. ## ====修改镜像====options(repos=c(CRAN="https: ...

安装并导入要用到的R包 BiocManager::install("clusterProfiler") #感谢Y叔的clusterprofiler包 BiocManager::in ...

很长一段时间,总是被安装一些包所绊住,或许今天也是.往往小阴沟就会翻船.死都不敢相信自己是这么死的.R包就是众多坑沟中的臭名昭著的一个.版本不对,依赖不存在,各种问题简直让一个有强迫症的患者生不如死. ...

最近很多人问我的问题都是R包安装的问题.在之前R包只要更新到最新版本,且能够联网,就可以轻松安装.,但现在随着R的功能越来越多,越来越强大.R包也越来越难安装了.并且什么人都可以开发发布R包,很多垃圾 ...

编译:晨晨,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读早在1951年,Sanger意识到蛋白可能是致病的根源,同时也可能是治疗疾病的关键,因此需要不断鉴定这些蛋白的关键作用.随着测序技术的 ...

编译:晨晨,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读早在1951年,Sanger意识到蛋白可能是致病的根源,同时也可能是治疗疾病的关键,因此需要不断鉴定这些蛋白的关键作用.随着测序技术的 ...

编译:苑志宇,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读细胞热位移测定法(CETSA)是最近出现的一种有发展前景的技术,可以直接监测完整细胞和组织样品中蛋白互作状态及其功能调节.最近 ...

编译:阿温,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 GPR52是一种A类孤儿G蛋白偶联受体(GPCR),被认为是治疗亨廷顿病和多种精神疾病的理想靶点.尽管最近有研究发现GPR52的 ...

编译:阿温,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读应激颗粒(SGs)是蛋白质和非翻译mRNA的细胞质组装体.虽然人们对SG地层已有许多了解,但对SGs在正常拆卸和疾病条件下发生的 ...

编译:小友,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在本篇文章中,我们定量分析了7000多种细胞蛋白和71种病毒蛋白,并提供了裂解性KSHV感染过程中蛋白变化的时间概况.裂解性KSH ...

编译:小北,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 2型糖尿病(T2D)在世界范围持续增加,包括心血管疾病在内的并发症也随之升高,研究代谢组学紊乱与糖尿病发病机制之间的关系是非常必要 ...

编译:小北,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在本期的<Cancer Cell>杂志上,Pillarsetty及其同事对潜在的抗癌药物PU-H71进行放射标记,结合 ...

编译:伊安,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肉瘤是一组具有70多个组织学亚型的间充质恶性肿瘤.目前大多数肉瘤发生发展的分子机制尚未明确,这阻碍了肉瘤的临床治疗和预后发展.迄今为止 ...

Bioconductor的质谱蛋白组学数据分析