玩转R包 / 开普饭

单细胞转录组测序很热,想必很多人都想学习一下.因为大家都喜欢热点,热点好搞基金,更好发文章,这是科研圈的共识.既然这么热,我们就从安装R包开始.这些包还是挺多的,包安装不好,后面的分析就没有办法做了呀 ...

一.R包的安装 0. 设置镜像 R和bioconductor的主服务器都在国外,设置镜像加快下载速度. ## ====修改镜像====options(repos=c(CRAN="https: ...

先下载代码包 github代码在:https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2/archive/master.zip 首先进入RNA-seq目录,从st ...

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

" 也许那是过去的你,你无法改变,但现在的你能够变得强大." --科白君 "R实战"专题·第2篇编辑 | 科白维尼 4445字 | 7分钟阅读本 ...

在前面的课程中,我们为大家介绍到R包主要来源于CRAN.Bioconductor和GitHub平台,具体的包安装方法可详见[R语言学习3]R语言程序包来源与使用方法简介,然而不同平台来源的包安装方法均 ...

对应原版教程2-3章 http://bioconductor.org/books/release/OSCA/ (对R基本了解的读者可跳过这一节) 1.简介 R语言是生信人最熟悉的编程语言之一,其核心在 ...

animalcules-交互式微生物组分析和可视化的R包 animalcules: interactive microbiome analytics and visualization in R Mi ...

R包是我们生息分析中不可缺少的工具,在学习和使用过程中,我们常会遇到:无法找到解决实际需要的函数,或希望有汇总的网站可以找到相关包的具体说明.搜索R包的途径有很多,例如分别通过RCRAN mirror ...

2017-03-21 17:45 之前我们分享过R语言绘制热图(),用的是pheatmap包.其实画热图还可以用heatmap函数.ggplot2包.gplot包.lattice包来画,惊呆了吧~~ ...

学习R的时候,我们都会用到R到自带数据集,或者第三方R包内含的数据集,比如iris鸢尾花数据. 有数据集,比如上面这个iris数据,但是我们不了解该数据集具体背景的话,就难以理解它的分析目的,统计分析 ...

写在前面这个包最优雅的地方在于交互式,所以学习的主要目的也就是交互式的实践.交互图可以很好的探索数据,但一般不支持输出矢量图,不方便下游编辑和修改和用于发表.如果你找到了导出矢量图方法,请留言. ...

英文原名:microeco: An R package for data mining in microbial community ecology 中文译名:微生物群落生态学数据挖掘的R包micro ...

我做扩增子分析流程中常用的R包下面介绍我常用的R包,还有一些R包比较底层,都会调用,但是不会被我们熟悉,也有一些R包我遗漏了,欢迎大家留言补充. 文件夹和文件管理 fs : 快速复制剪切文件,文件移 ...

写在前面: 在如何通过Google来使用ggplot2可视化这篇文章中,我们曾经介绍过R语言在生物信息学中的重要性. 这篇文章也激发了很多小伙伴学习的热情.学习R语言必然会安装各种各样的包,很多人在这 ...

hapmap计划的人群分布结果和千人基因组计划的分布结果来分析是一样的![直播]我的基因组55:简单的PCA分析千人基因组的人群分布这两个计划里面收集的样本的种群信息都比较完善,而且每个样本的基因型 ...

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