R包animalcules-一键式交互探索微生物组数据 / 开普饭

本文由卡内斯坦编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物组学研究主要涉及两方面技术:测序技术和数据分析技术.近年来,这两方面技术都在不断进步.如何为自己的研究选择恰当的技术方法 ...

learning_microbiome_2 这两个包的安装比较麻烦无法下载得到github包,或者无法安装后,将github包手动下载下来,解压之后定位文件夹名称后安装这部分用来学习微生物组成的操 ...

推荐:江舜尧编译:番茄加牛腩同学编辑:小菌菌荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯大学医学中心/英国牛津大学Nuffield人口健康学部Jun Liu和Cornelia M. vanDuijn等于2020年1月1 ...

这是<肠道产业>第 569 篇文章编者按: 微软公司的联合创始人比尔·盖茨坚定地认为,了解微生物组"在未来 20 年里,不亚于我们在健康领域所做的任何其他事情".而麦 ...

写在前面目前我们在Easystat用于数据差异分析及其可视化方面做了很多的工作,尤其是大大扩展了可视化的类型,相信大家总能找到一种适合自己的可视化方式.现在我带领大家使用此包进行微生物组数据的差异分 ...

写在前面题目错误,更正为:EasyStat包.我们在分析群落数据的时候,往往相对丰度转化后就展示了,在差异分析中往往使用相对丰度做差异分析不是上上策,因为目前edger和Desep2包中的标准化方式 ...

gcMeta全球微生物组数据存储和标准分析平台 gcMeta: a Global Catalogue of Metagenomics platform to support the archiving ...

英文原名:microeco: An R package for data mining in microbial community ecology 中文译名:微生物群落生态学数据挖掘的R包micro ...

我做扩增子分析流程中常用的R包下面介绍我常用的R包,还有一些R包比较底层,都会调用,但是不会被我们熟悉,也有一些R包我遗漏了,欢迎大家留言补充. 文件夹和文件管理 fs : 快速复制剪切文件,文件移 ...

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