PCA分析？Emm，所有人快速上手与出图！ / 开普饭

重测序便宜了,群体的测序和分析也多了起来.群体结构分析,是重测序最常见的分析内容.群体结构分析应用十分广泛,首先其本身是群体进化关系分析里面最基础的分析内容,其次在进行GWAS分析的时候,本身也需要使 ...

学徒培养进行到了转录组实战环节,按照惯例我会挑选10+篇比较新的带数据集的RNA-seq文章给到学徒,让大家实战. 大家需要自己去找到数据集背后的测序数据,然后使用aspera下载fq文件,走hisa ...

编译:小鹿同学,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读核磁共振(NMR)光谱是研究未知代谢物的最佳工具.此外,代谢组学是检查体内和体外代谢情况的系统方法,其可以提供有关癌症代谢变化的数 ...

与此同时,不少粉丝对GSVA或者ssGSEA分析方法提出了要求,变相催稿.其实GSVA或者ssGSEA是有成熟的工具,我暂时没有找到它们的卖点.不过,我注意到了一个GitHub包,ncborcherd ...

常规的T检验.方差分析等,可以用于比较组间变量的差异水平.由于这些常规方法都是对于1-2个特定变量而言的,那么如果我们想比较所有变量整体的差异,或者说各组对象间在变量组成上是否存在较大的不同,应该怎样 ...

最近,bioconductor团队出版了一本电子书,其整合了其网站上关于单细胞的R包并制定了一套常规的分析流程包括分析,可视化,导入导出.不仅如此,前三章还分别教你如何下载使用R,使用biocondu ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读利用Kraken2联合Bracken的方法能快速.准确的从宏基因组测序数据中获取物种的注释和丰度信息(详见第二篇), ...

GIS前沿昨天 1. 数据准备:村级行政区划 *必备列:编号(以FID顺序)方便后续链接 2. 缓冲区分析:缓冲向导工具 *必备列:编号(因缓冲区顺序与行政区顺序一致,故可直接链接行政区名称) 3. ...

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好久不见,我们的直播又开始啦!今天,我们主要讲的是人群分布,先用简单的PCA来分析一下千人基因组的人群分布吧! PCA分析,就是主成分分析,我博客有讲过(点击最底部的阅读原文或复制链接http://w ...

[上回META分析]白蓝控席卷2500人巨赛!红牛 Untapped 第一场线上资格赛以前我提到过,火球频道开始实行会员制,需要购买会员才能阅读网站中火球 pro 的文章.在昨天,火球办了一场针对会 ...

"嘭"."咚"."咔嚓"."铛锒" 油门,刹车,哪个是哪个往右.往右.前进.后退一着急就懵x 俗话说:满瓶子不动,半 ...

在当今社会,人人都是自媒体的时代真的不远了,而且自媒体有很多盈利模式,既能变现也可以增强自己的能力,所以越来越多的自媒体人出现了.今天,准哥想分享的就是小白怎样才能快速上手做自媒体,希望能对踏上自媒体 ...

并把小熊猫[设为星标] 百度集团(09888.HK) 百度集团今天出中签结果了: 甲组近40万人申购,这应该是目前的这些热票中最少参与认购人数的一个票了,一手中签率15%,申购50手稳中1手,甲尾20 ...

2015 年中国新发乳腺癌病例约 27.2 万,死亡约 7 万余例.早期患者中 30%-40% 可发展为晚期乳腺癌(ABC),5 年生存率约 20%.ABC 是乳腺癌发展的特殊阶段,在治疗选择及疗效方 ...

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