借鉴escape包的一些可视化GSVA或者ssGSEA结果矩阵的方法 / 开普饭

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

书接上文,gsva后续的处理很简单,如果熟悉差异基因分析包limma的话,更是简单.之前我们得到的gsva分数的矩阵就类似于基因表达矩阵,按照这个思路继续往下即可: 从通路的表达矩阵开始,我们进行差异 ...

关于免疫浸润分析,可谓是最近一段时间的热点,很多文章基于肿瘤免疫细胞微环境进行分析,不管是进行下游基因筛选也好,还是构建诊断模型也好,发表了很多相关的研究.在前面关于<CIBERSORT在免疫浸 ...

本篇文章价值超200元,为什么这么说呢,我在网上查询GSVA资料的时候看到一个课程,标价是200,23人学过.作为一个在线课程,录制完以后就可以持续的收益,不说远了,5年后还是会有人买这个课程,所以说 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

Py之pyecharts:python包之数据可视化包pyecharts简介.安装.使用方法之详细攻略相关文章百度官网echarts案例 Py之pyecharts:python包之数据可视化包py ...

丨本文由小陈茶事原创丨首发于头条号:小陈茶事丨作者:村姑陈 <1> 望文生义,是个贬义词. 在存茶时,单从字面上理解白茶储存的"三层包装法",是个错误. 之前茶友问 ...

最近市场的大长腿很多一旦捕捉到就是非常丰厚的利润我们的涨停是10个点一般股价如果是从负的到涨停就是10多个点了,也就是我们常说的大长腿大长腿实际上可以分为很多类的也就衍生出很多的方法,这里 ...

夏季炎热,雨水频繁,自家菜地的蔬菜,长势喜人,尤其在一场小雨过后,豆角.辣椒.茄子都明显长了不少,一年四季,我最喜欢的就是夏天了,除了神清气爽,还有吃不完的蔬菜,不像寒冷冬季,只能吃大棚蔬菜,怎么炒都 ...

乡村小韩妈妈10.7万粉丝 · 753视频

端午节也称端阳节,是中华民族的传统节日,与春节.清明.中秋并称为中国民间四大传统节日,可见其在我国传统文化中的地位之重,端午的一个重大活动除了赛龙舟,还有就是包粽子,传说端午屈原投江,百姓为了祭奠屈原 ...

Py之seaborn:数据可视化seaborn库(三)的矩阵图可视化之jointplot函数.JointGrid函数.pairplot函数.PairGrid函数.FacetGrid函数的简介.使用方法 ...

animalcules-交互式微生物组分析和可视化的R包 animalcules: interactive microbiome analytics and visualization in R Mi ...

借鉴escape包的一些可视化GSVA或者ssGSEA结果矩阵的方法