【后续来了】有了这个包，猪的GSEA和GSVA分析也不在话下（第二集） / 开普饭

https://stackoverflow.com/questions/55290819/extend-ggplot-geom-ribbon-in-the-x-directionlibrary(tid ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵学习目标了解R言语使用的各种数据类型和数据结构在R中使用函数并了解如何获取有关参数的帮助使用dplyr ...

GSVA其实就是pathway级别的差异分析,根据GSVA的原理其实就是计算每个sample的GSEA然后得出类似pathway enrich score,把这个可以当作芯片的表达数据一样,再用lim ...

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

葡萄的参考基因组下载自NCBI,下载链接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/003/745/GCF_000003745.3_12X/ 基 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

在数据分析中,Python和R各有千秋,虽然Python或R都能在数据分析打通关,从采集.清洗(预处理).分析.可视化,但是在不同的环节,不同的语言易用程度不同.Python胜在干脏活累活,诸如数据采 ...

kaggle竞赛宝典干货作者:杰少时间序列王器-Kats 简介时间序列分析建模是数据科学和机器学习的一个重要的领域,在电子商务.金融.供应链管理.医学.气象.能源.天文等诸多领域有着广泛的应用. ...

ggplot可视化矩阵可视化谱图案例 library(dplyr) library(ggplot2) # The most common use for rectangles is to draw ...

以前一直用经典的MCP法分免疫浸润总感觉不好上篇文章上也写过这次用肠癌单细胞6万多的细胞的特异性基因,特异性基因我是一个一个看的,我选的标准是logfc大于1,而且如果是肿瘤细胞的特异性基因,那 ...

径向柱形图也被称为圆形柱形图或星图.这种图表使用同心圆网格来绘制条形图每个圆圈表示一个数值刻度,而径向分隔线(从中心延伸出来的线)则用作区分不同类别或间隔(如果是直方图).刻度上较低的数值通常由中心 ...

会议时间:2021/03/17 19:30-21:30 (GMT+08:00) 点击链接入会,或添加至会议列表:https://meeting.tencent.com/s/H9goXk0EWnqO 会 ...

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