不同的GSE数据集有不同的临床信息，不同的分组技巧 / 开普饭

之前在介绍GEO数据库数据分析的时候,我们介绍过GEO2R这个在线的分析GEO芯片数据的工具.但是对于GEO里面的一些二代测序的数据,就没办法进行分析了.最近新发布了一个在线的数据库eVITTA,则可 ...

GEO虽是一个宝库,但是使用GEO进行数据分析可不是一件简单的事! 首先,GEO的数据检索非常不方便,例如,我想获取有预后信息的乳腺癌数据,显然使用GEO官方检索起来很难. 其次,GEO大部分数据都基 ...

Identification of immune subtypes and prognosis of hepatocellular carcinoma based on immune checkpoi ...

前段时间,我们对于批次效应有关的东西进行了一些介绍.其中包括 [[批次效应]] [[批次效应去除工具]] 对于经常使用的TCGA数据库而言,同样也有批次效应存在.对于这样的批次,在公布之前也经过一定的 ...

小编最近写微信文的苦恼就是很难找到合适的.想要跟大家分享的文章.看完这篇文章之后简直眼前一亮 ,易懂却又有深度的多组学研究文章,行文逻辑一气呵成,解读起来也畅快,墙裂推荐!文章题目:Metabolic ...

导语今天和大家分享的是2020年10月份发表在Theranostic杂志(IF=8.579)的一篇文章"A panel of eight microRNAs is a good predi ...

发现一个工具,发表在 BMC Bioinformatics201415:323 https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-323,很简单的设计,就是考虑到做多个GSE数 ...

物业名称Property name描述Description种类kind资源类型.The resource type.等份[]aliquots[]从该参与者处提取的等分条形码的列表.List of b ...

(本文仅供学习.参考,不能替代医嘱和处方.文中所述配伍.方剂,必须在中医师当面辨证指导下来借鉴.应用.切勿盲目尝试!) 本文理论依据:<常用腧穴临床发挥> 你好,我是中医人,文君然. 前几 ...

本文的临床数据的生存分析,并没有使用TCGA数据库里面的病人信息,而是自己收集病人样本,记录其临床信息,随访时间等等.还采用IHC等病理技术手段来量化感兴趣的基因的表达量情况,最后全部使用自己的数据做 ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

相关资讯预告:第五届全国肝病免疫和生物治疗研讨会第五届全国肝病免疫和生物治疗研讨会将于2012年4月13日在北京召开.主办单位: 中国免疫学会感染免疫分会.全军传染病专业委员会承办单位: 生物谷大 ...

每个癌症都去找各自的肿瘤突变maf文件很麻烦,所以我们才会选择 PanCanAtlas Publications Scalable Open Science Approach for Mutation ...

这个数据库的工作流程这个数据库的功能 Functional effects of variants, such as stop-gain, splicing, nonsynonymous, and ...

一咳咳不停,咳嗽"最怕"8大中成药,临床都在用,小问题轻松解决,收藏备用! [1]养阴清肺膏-- 成分为地黄,麦冬,玄参,川贝母,白芍,牡丹皮,薄荷,甘草.具有养阴润燥,清肺利咽的 ...

不同的GSE数据集有不同的临床信息，不同的分组技巧