使用pyBigWig模块查看bigwig文件中的内容 / 开普饭

昨天,我们了解了一下SAM格式的比对结果,不知道大家理解的怎么样.但是全基因组测序数据实在是太大了,即使比对后把sam文件压缩成二进制的bam文件也还有55G(如何压缩转换可查看直播十二),如果完整的 ...

一.配置参数 UCSC基因组浏览器地址: https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?db=mm10&lastVirtModeType=default&a ...

我们在之前说到过bam文件还有55G大小,这样的文件,在很多时候都不方便查看和转移.而有些时候,我们只需要我们的测序数据在全基因组的测序深度这一个值,并不需要具体某条reads的碱基序列,碱基质量值. ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

Hi-C的起源与发展 1953年,沃森和克里克发现DNA双螺旋结构,这标志着生物界进入基因组的研究时代.此后不久,胰岛素的氨基酸序列得以破解,DNA测序逐渐成为生物学家的重要目标.1975年Frede ...

我看到一个biostars论坛提问很有趣 The code I used; $ computeMatrix scale-regions -S Sample1.bw Sample2.bw Sample3 ...

sed 是 stream editor 的缩写,中文称之为"流编辑器". sed 命令是一个面向行处理的工具,它以"行"为处理单位,针对每一行进行处理,处理后的 ...

在Redhat系列的Linux发行版中,相对于RPM(RPM Package Manager), YUM(Yello dog updater)具有更强大的功能,安装YUM管理的软件包可以自动解决依赖问 ...

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如何快速的将其他文件中的图片复制过来?我们要高效的做事点击上方"Excel和VBA",选择"置顶公众号" 致力于原创分享Excel的相关知识,源码,源文件打包 ...

Win7系统如何查看系统日志文件?系统日志文件在电脑出现故障或者问题的时候记录下原因,让用户在修复的过程中提供分析帮助,那系统的日志文件放在哪里?要怎么打开查看?下面小编介绍Win7系统查看系统日志文 ...

问题:工作中遇到一个需求:需要在ld script中使用类似C语言的define等宏定义来做一些判断和替换实验: 1:理论上*.c中都能用,是否gcc/ld也支持在ld script中直接用宏呢,结 ...

已知学生成绩数据文件中存放学生的学号.班级.数学成绩.英语成绩.语文成绩.统计每个班级的各门课程的平均分,可使用的命令是: ( D ) A. 选择个案 B. 计算变量 C. 对个案内 ...

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