【直播】我的基因组 35：bam格式转化为bw格式看测序深度分布 / 开普饭

[软件介绍]IGV软件的安装和基本介绍 - 目录 1. IGV 下载与安装 2. Java 安装及环境变量设置 3. IGV 基本介绍 3.1 IGV 界面布局 3.2 IGV 结果界面 3.3 序列 ...

bam, bedgraph, bigwig是3种常见的存储测序深度信息的文件,都可以方便的导入IGV浏览器进行查看,其中bigwig最为常用.在chip_seq, atac_seq中,通常都会提供该种 ...

一.配置参数 UCSC基因组浏览器地址: https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?db=mm10&lastVirtModeType=default&a ...

GATK教程我以前写过(GATK使用注意事项:http://www.bio-info-trainee.com/838.html) 这个步骤分成2个小步骤: 首先用RealignerTargetCrea ...

看来本次直播我的基因组分析流程效果还不错,不少朋友跟着自己动手开始分析全基因组测试数据了,值得表扬.其中有好几个朋友留言向我反映公司给的统计报告里面的覆盖度的问题,如下图: 我在第 8讲中写道,每条染 ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

进到align目录对质量好的测序数据进行比对 1. 一个个比对,生成BAM文件 align目录 sample=SRR7696207 bwa mem -t 2 -R "@RG\tID:$sa ...

关键词:Excel2016:条件格式:到指定日期不显示,操作难度*** 工作中难免要进行文件交换,比如今天教务处王处长提了一个小小的要求:"小菜,有没有可能对咱们公布的课时统计月报进行限制, ...

今年娱乐圈发生的大事还真的是挺多的呢,不管是明星们的感情生活上的,还是选秀方面的瓜都是一个比一个大呢, 相比起起来赵丽颖和冯绍峰离婚这种事真的算是小事了,毕竟就连普通人感情不好都会分开, 赵丽颖 ...

Harvard格式作为留学生在写作论文时经常用到的主要引用格式之一,是令许多留学生感到头疼的一件事,因为我们中的大多数对应该如何使用哈佛引用格式并不十分地清楚.本文为大家分享Harvard格式与其参考 ...

【直播】我的基因组 35：bam格式转化为bw格式看测序深度分布