生信流程大全-基于nextflow的nf-core / 开普饭

在第一节中,我们介绍了nextflow的平台支持和安装方法,这一节我们将介绍流程监控的利器nextflow tower. 相信之前自己搭建过生信流程的小伙伴对流程监控的重要性都非常清楚,俗话说:&qu ...

Tenet3: Attack the process and engage your people in developing solutions. Asmanagers we should obse ...

写在前面每个人的时间都是有限的. 昨夜反思,当我发现博士生活已经过了一年半,而我也需要耗费一定量的时间在实验上的时候,我开始有顾虑.我认知中的成长是需要时间的,浮沙筑高楼是不可能持久的. 这类观点 ...

在前面的两节内容中我们介绍了Nextflow的安装和流程监控平台Nextflow Tower, 大家如果对软件安装还有疑问可以查阅平台中前面两节的内容.这里我们以nextflow的一个具体运行脚本来进 ...

在本系列中,我们将使用预训练的模型来创建一个iOS应用程序,该应用程序将在实时摄像头Feed中(而非静态图片中)检测多个人和物体. 在本文中,我们将从YOLO对象检测模型从开放神经网络交换格式(ONN ...

本节我们介绍Nextflow中的Channel类型,Channel是nextflow中process之间进行数据传递的通道. Channel主要有两个属性: 采用异步操作的方式进行数据传递: 数据接收 ...

Linux系统方法一安装anaconda后,系统默认python环境是anaconda 默认创建的"root"/"base"环境,这是因为它把"启 ...

安装dgl 并运行的时候,出现了如上错误,很是郁闷:使用 gdb python; run train.py 进行调试,发现是torch的问题:我猜测估计是torch 安装的版本过于新:于是重新安装 1 ...

大家好,我是李剑峰,生信技能树论坛的VIP小编,目前在上海交通大学医学院附属瑞金医院进行研究生阶段的学习,主要研究方向是生物信息学.医学信息学.大数据综合分析.临床诊断数据分析.DNA-seq, RN ...

本节我们介绍Nextflow中的Combine Operators类型.Combine-operators-合并操作符合并操作符包含以下类型:joincrosscollectFilecombineco ...

本节我们介绍Nextflow中的Splitting operator类型.Splitting operators-分割操作符分割操作符用于将channel中的元素分割成不同的块儿,这些块结构将会下游的 ...

本节我们介绍Nextflow中Transforming operators类型.Transforming operators-转换操作符转换操作符包括buffer, collate, collect, ...

本节我们介绍Nextflow中的Operator类型,Operator用户连接不同的Channel或者按照用户指定的规则进行数据的变换操作. Operators分为以下7种类型: Filtering ...

像经常处理生物信息大数据的同学,肯定有自己一套的分析脚本,也就是常说的pipeline了.在我刚开始的时候,也是按照大伙的分析流程,一步一个脚本,后来熟悉了一些,会把经常用到的脚本放在一起,再用变量名 ...

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