16s测序分析没过时，还可以发9分的SCI哦！！

今年6月份，浙江大学邵勇奇老师团队在国际顶级微生态期刊《The ISME Journal》上发表了题为《Gut bacterial and fungal communities of the domesticated silkworm (Bombyx mori) and wild mulberry-feeding relatives》的研究性文章，首次揭示了家蚕肠道细菌和真菌的组成。该研究只进行了66个样本的测序分析 [1]。

前几天，美国乔治华盛顿大学计算生物学研究所Marcos Pérez-Losada等人在《Microbiome》发表题目为《Pediatric asthma comprises different phenotypic clusters with unique nasal microbiotas》的文章。该研究通过结合广泛的临床信息和16S rRNA高通量测序，进而分析了163名不同哮喘表型的儿童和青少年的鼻腔微生物群。

第一篇文章已经在之前讲解过，本文主要介绍一下第二篇文章，该文章实验思路，分析方法和写作手法都值得学习，小编不才，不能一一道来，感兴趣的朋友可以阅读原文。

研究关键词

16S rRNA，哮喘，微生物组，鼻，表型

研究摘要

背景：小儿哮喘是美国最常见的慢性儿童期疾病，目前影响约700万儿童。该异质综合征被认为包括临床可观察到的各种疾病表型，其可通过应用聚类方法对患者临床信息进行统计学鉴定。大量证据表明，气道微生物组影响儿科哮喘的临床异质性和发病机制。然而，到目前为止，气道微生物在哮喘表型的研究中一直被忽视。在这里，我们将广泛的临床信息与16S rRNA高通量测序相结合，来分析163名不同的哮喘表型的儿童和青少年的鼻腔微生物群，这些儿童和青少年聚集成。

结果：我们的聚类分析确定了三种不同的儿科哮喘表型。致病菌莫拉氏菌，葡萄球菌，链球菌和嗜血杆菌的核心OTUs存在于至少95％的研究的鼻微生物群中。在哮喘表型和其中一个临床变量（早产）之间，细菌门（变形菌门，放线菌门和拟杆菌门）和细菌属（Moraxella，Corynebacterium，Dolosigranulum和Prevotella）的丰度，群落组成和结构差异显著（0.05 <P≤0.0001）。类似地，细菌属共生的微生物网络揭示了哮喘表型的不同细菌的相关性。

结论：本研究表明，具有不同哮喘临床特征的儿童和青少年也表现出不同的鼻细菌特征，这表明该疾病的表型不同。本研究还展示了如何整合临床和微生物信息以验证和改进哮喘分类系统并开发疾病的生物标志物。

文中主要图片说明

图1 三种不同哮喘表型簇（APCs）的儿童和青少年鼻腔微生物组中最丰富（> 1％）门和属的微生物特征（平均相对比例）

图2 属于三种不同哮喘表型簇（APC）的儿童和青少年鼻微生物组中微生物共生的网络分析。每种表型使用不同的颜色。细边对应于0.90的概率，而粗边对应于0.95的概率。仅显示网络中涉及的细菌属。

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[1] 肠道微生物多样性如何任性发9分

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