16S测序全新分析流程QIIME2的介绍
相关推荐
-
16S微生物组研究的 “最佳共识”
高通量测序平台的出现彻底改变了对复杂微生物群落的研究.最常见的是,标记基因(例如16S rRNA和18S rRNA基因)的扩增和测序,提供定性和定量(即相对丰度)数据.可用于进行标记基因分析的方法多种 ...
-
以呼吸道微生物组研究为例:探索一步或两步PCR方案在16S rRNA V3V4与V4基因区域的偏差
迄今为止,已经有了许多对呼吸道微生物组通过16S rRNA高通量测序的研究.这其中所有基于扩增子的研究的共同之处就是PCR的应用: 一是扩增待测序的目标标记基因, 二是为多样本的混合测序添加必要的索引 ...
-
技术贴 | 16S专题 |基于QIIME2 dada2插件的16S扩增子测序数据的分析流程详解(下)
本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导 读 明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...
-
16s测序分析没过时,还可以发9分的SCI哦!!
今年6月份,浙江大学邵勇奇老师团队在国际顶级微生态期刊<The ISME Journal>上发表了题为<Gut bacterial and fungal communities of ...
-
MPB:中南大学刘学端、马丽媛组-基于16S测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析
为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...
-
(一)16S测序的背景知识介绍
(一)16S测序的背景知识介绍
-
办理蓝牙FCC认证的测试流程与项目介绍
根据蓝牙版本的不同,目前蓝牙版本分为V2.0,V2.1,V3.0和V4.0不同版本.芯片大都喜欢采用CSR芯片.在进行蓝牙测试时需要由制造方提供工程样机和定频控制软件. 具体测试项目包括: 1.RF功 ...
-
基于TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析流程
分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...
-
二代测序(Next generation sequencing)介绍
二代测序(Next generation sequencing)介绍
-
USEARCH — 最简单易学的扩增子分析流程(中国总代理)
USEARCH -- 最简单易学的扩增子分析流程 USEARCH官方英文主页:http://www.drive5.com/usearch/ 本站经USEARCH作者Robert Edgar授权,由&l ...
-
科研│Rice:利用QTL测序和转录组测序联合分析水稻芽期耐盐性主效QTL及候选基因(国人佳作)
编译:秦时明月,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 盐胁迫是限制全球水稻生产的主要非生物胁迫之一.直播栽培模式下,水稻芽期耐盐性直接影响秧苗成活率和最终产量.然而,有关芽期耐盐性的数 ...