易学的4+单细胞下游分析 / 开普饭

我注意到绝大部分肿瘤相关的单细胞转录组研究的落脚点都是在肿瘤免疫微环境个细胞亚群比例,包括 B细胞,T细胞,巨噬细胞,树突细胞等等,而且这些细胞亚群都是可以继续细分.但实际上在没有单细胞转录组数据这个 ...

前面我们一起学习到了单细胞转录组数据的降维聚类分群,而且拿到的亚群,也可以解释其生物学意义,见:单细胞转录组数据处理之细胞亚群注释其实理论上细胞亚群是可以无限划分的,因为世界上没有两个一模一样的细胞 ...

Abnormal overexpression of G9a in melanoma cells promotes cancer progression via upregulation of the ...

Mechanism- and Immune Landscape-Based Ranking of Therapeutic Responsiveness of 22 Major Human Cancer ...

考虑到咱们生信技能树粉丝对单细胞数据挖掘的需求,我开通了一个专栏<100个单细胞转录组数据降维聚类分群图表复现>,也亲自示范了几个,不过自己带娃,读博,时间精力有限,所以把剩余的90多个任 ...

2021年2月3日,致力于开发免疫肿瘤抗体药物的生物制药公司Eucure Biopharma宣布,其在研抗CD40抗体药物(YH003)与君实生物的抗PD-1抗体特瑞普利单抗(Toripalimab) ...

2016-07-28 10:11:59 免疫细胞(immune cell)是白细胞的俗称,包括淋巴细胞和各种吞噬细胞等,也特指能识别抗原.产生特异性免疫应答的淋巴细胞等,淋巴细胞是免疫系统的基本成分. ...

新课发布在B站了,马上有热心的粉丝看完后写了配套笔记: 下面是粉丝linbo的笔记投稿前言视频地址:https://www.bilibili.com/video/BV19Q4y1R7cu 一般来讲 ...

单细胞转录组的流行趋势让我们惊讶,不少有钱的课题组甚至宣传以后只上单细胞转录组,传统的bulk测序干脆不做了,可是花了几百万经费拿到一堆表达矩阵,然后呢? 诚然,单细胞转录组的确是CNS一大波,仅仅是 ...

如果你看了我的单细胞转录组数据分析的基础10讲: 01. 上游分析流程 02.课题多少个样品,测序数据量如何 03. 过滤不合格细胞和基因(数据质控很重要) 04. 过滤线粒体核糖体基因 05. 去 ...

前面我在单细胞天地的教程:10X单细胞转录组理论上有3个文件才能被读入R进行seurat分析,预告了一个粉丝遇到的疑难点,数据集GSE127465里面明明是可以下载到看起来是10X标准的3个文件,但是 ...

单细胞基因组学人体所有细胞的累积活动,以及它们无数的相互作用.生活史和环境体验,导致了人类个体独特的状态. 对人类细胞类型进行分类,了解它们是如何形成的,如何在个体间变化,以及如何在疾病中丧失功能的 ...

编译:刘娟,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读由于技术的限制,移植后的造血干细胞(HSCs)在预条件性宿主体内定位后的行为尚未被研究.本文利用单细胞RNA测序,首先获得28种造血细 ...

编译:逍遥君,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肝内胆管细胞癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICC)是肝脏第二大最常见的恶性肿瘤.因此,在单细 ...

编译:杨峰,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 哺乳动物半月板是由内侧和外侧两部分组成的新月形组织,在关节稳定性.减震.接触力分布.关节润滑和本体感觉等方面发挥着重要作用.随着年龄的增长, ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读霍奇金淋巴瘤(HL)的特点是该肿瘤微环境(TME)主要由不同类型非癌性免疫细胞和罕见的恶性细胞所主导.细胞成分及其空间关系的表征对 ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 清华大学.北大三院.广州再生医学与健康广东省实验室马普中心等单位付卫.杨雪瑞和陈晔光等人于2019年11月21日在医学国际权威期刊Jou ...

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