引出你的课题聚焦的基因-差异和生存
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生信分析44.乳腺癌的免疫浸润,有点创新
生信论文的套路 ONCOMINE从全景.亚型两个维度做表达差异分析: 临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要: Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性: cBi ...
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又一个肿瘤免疫浸润分析利器
关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...
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可能是最出名的TCGA表达相关数据库介绍(一)
有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA 数据库的用法,正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧. 有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA ...
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【生信挖掘】模块化代码复现6分免疫相关lncRNA预后模型
生信已经成为科研圈发SCI的神器了,检索PubMed上可见发表的文章不管高分低分都涉及生信,但是许多人听见生信编程就望而却步,产生恐惧心理,我们特邀请医科堂生信挖掘一对一辅导训练营周老师开设专栏,通过 ...
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太牛了,纯生信数据挖掘发表了4.7分非OA的SCI
文章题目:Identification of a novel gene expression signature associated with overall survival in patient ...
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GEO数据纯生信准3分SCI思路
研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...
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生信工具 | TCGA数据分析工具GEPIA最新更新,用于免疫细胞浸润分析
GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...
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只聚焦一个基因如何进行下一步研究?
之前有小伙伴提问说,老板只给了一个基因让在胃癌当中研究.组内的测序数据也不让用,想要往下做一些和这个基因有关的基础实验,这个该怎么弄呢? 前段时间给大家介绍了很多很多的数据库,有时候单纯的数据库介绍的 ...
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早读|聚焦肺癌患者五年长生存:免疫治疗有优势?
总 结 免疫治疗的持久应答带来了长拖尾效应, NSCLC治疗方案历经时代变迁,已步入3.0免疫治疗时代 抗肿瘤药物研发的成功率极低,选对研究终点十分重要,二期单臂试验可以选择ORR作为主要终点,有望作 ...
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【文献解读】聚焦E-cadherin:肿瘤立足生存先 再谈开疆扩土
<Nature>首次发现,癌症转移并不需要的E-cadherin,实际是保证肿瘤细胞生存的关键. 背景 肿瘤细胞在早期会疯狂生长,侵入和传播到组织内,形成肿瘤.晚期则会转移,形成新 ...
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非小细胞肺癌患者EGFR-TKIs治疗后三种疾病进展模式的基因突变和生存分析
靶向药的使用显著提高了EGFR突变阳性晚期NSCLC 患者的生存率,然而大多数患者用药一段时间后无法避免会出现疾病进展.基于临床进展模型克服耐药性的治疗策略是精准靶向治疗的基石.Yang等根据疾病控制 ...
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人和香蕉基因相似度60%,那为什么香蕉和人差异这么大?
基因这个问题一直都困扰着不少科学家,因为以我们目前的技术来说,对于基因的研究还是太困难了,每个生物体内都有不一样的基因排列顺序和数量,就算是人类,也有个体和个体之间的基因差异,所以对于科学家来说,研究 ...
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颠覆性发现:同卵双胞胎的基因并不完全相同,胚胎早期就出现差异
撰文 | nagashi 众所周知,双胞胎可以分为两种:同卵双生或异卵双生.同卵双生的双胞胎,是由同一个受精卵分裂而来,理论上遗传物质是一致的,性别当然也必然一致:而异卵双生的双胞胎,是由不同的精子和 ...
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科研│PLANT J:基因共表达分析揭示干旱胁迫下野生和栽培鹰嘴豆转录组的差异
编译:微科盟 伊一,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 作物野生亲缘物种的祖先适应性可以为作物改良提供遗传储备.在这里,研究者记录了野生和栽培鹰嘴豆的轻度和重度干旱胁迫的生理变 ...
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科研│BIOTECHNOL BIOFUELS:比较转录组分析两种不同生长速率的杨树基因型之间的基因和基因模块差异(国人佳作)
编译:伊一,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 背景:木材为全球生物燃料生产提供了重要的生物质资源.树干的径向生长对于林业和生物燃料的生物量生产至关重要,但从基因上剖析是有挑战性的, ...
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科研 | Industrial Crops & Products:代谢组与转录组揭示三种烟草的代谢多样性与差异基因
编译:菜鸟菠萝,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 烟草是一种重要的经济农作物,叶片是重要的芳香生物活性化合物(如酚类和生物碱)的来源.在本研究中,采用无偏转录组学和代谢组学方法来鉴 ...