只聚焦一个基因如何进行下一步研究？ / 开普饭

利用一周多的时间,我们把最最基本的生信套路来讲解了一遍.正好前几天一个小伙伴拿了一篇相关文献在咨询问题.这里就拿这篇文献来总结一下我们目前写的这些东西. 这次我们来讲解的这边文献是2019-10-12 ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

一提到数据挖掘,可能大家都会想到肿瘤数据挖掘,而是忽略非肿瘤的方向.今天,我们就给大家介绍一下非肿瘤方向的数据挖掘.作者是日本人,研究是的慢性牙周炎,也就是口腔科,文章发表在BMC Oral Heal ...

通过差不多十天左右的推送,我们基本上把生信分析最最基本的套路从头到尾讲了一下.这里就把之前的帖子总结一下(顺便水一篇 ),算是一个总结帖吧!基本的分析思路就是下面的一个流程: 对于这种分析套路我们写了 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2541天零代码复现非肿瘤文章大家好,我是濤濤.众所周知,仙桃生信工具www.xiantao.love一直致力于协助大家在进行生信研究提供便利性.最近,仙桃生信工具又推 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2415天 lncRNA数据库中的多面手由于今天这款lncRNA数据库实在是重磅,我就直接告诉大家吧,不管你是做基础研究还是做疾病研究,不管你是研究肿瘤还是非肿瘤,不管你 ...

前几天和大家介绍了一下GEO数据库以及使用GEO2R进行差异表达分析GEO2R差异表达分析软件.几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析.那么GO和KEGG都是什么?富 ...

我们在基因研究的时候,需要提前预测这个基因的功能是什么.编码基因可以通过其基因的蛋白结构来预测到主要功能是什么.但是对于长链非编码RNA(lncRNA)的功能,由于其不编码蛋白.这样功能预测的就不适用 ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

Starbase数据库于2011年上线,目前更新到3.0版本,开发者是中山大学RNA信息中心的屈良鹄研究团队.Starbase是做lncRNA/circRNA/microRNA等研究常用的强大数据库, ...

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear ...

在进行高通量测序的时候,我们在会得到很多的候选基因.但是对于基础实验而言,我们往往只需要寻找到这些基因当中重要的那些基因来进行后续的实验即可.但是这么多基因该怎么寻找的呢? 这个一般可以通过通路富集或 ...

只聚焦一个基因如何进行下一步研究？