单细胞转录组测序中的批次效应知多少？（下） / 开普饭

据中科博生研究表明,干细胞能在大脑的整个生命周期中产生新的神经细胞.海马是发生这种情况的地方之一.在抑郁症和阿尔茨海默病的情况下,观察到新形成的神经细胞数量减少,这与患者的记忆能力下降有关.中科博生. ...

转录组测序技术 (RNA-seq) 具有广泛的应用,RNA-seq数据分析主要步骤包括实验设计,质量控制,reads比对,基因和转录水平的定量,差异基因表达,可变剪接,功能分析,基因融合检测和eQTL ...

作物生产力取决于分生组织的活动,分生组织产生优化的植物结构,包括玉米穗的结构.全面了解发育需要了解细胞类型和发育域的多样性以及指定它们所需的基因网络.到目前为止,这些基因主要是通过形态学和经典遗传学的 ...

写教程的话,我的优点仅仅是量大,坚持了七年多写了超1万篇教程.但实际上绝大部分都浮于表面,深度不够. 恰好最近看到了一个超级优秀的博客,安排了其中几篇给学徒们翻译和理解,超级值得读! 阅读前面的翻译稿 ...

高通量单细胞测序的本质是细胞与barcode的独立配对,但往往很难达到在满足通量要求下的完美效率.促使笔者写这篇文章的原因,是最近发表在Nature method上的一篇文章Ultra-high-th ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉法国图卢兹癌症研究中心学者Jean-Jacques Fourniéa等人于2019年5月22日在<PNAS>上发表题目为<Single-cell ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉费城儿童医院学者Kai Tan等人于2019年5月7日在<Genome Biology>上发表题目为<SCRABBLE: single-cell ...

英国学者Sarah A. Teichmann.Kedar Nath Natarajan联合华大Shiping Liu等人于2019年4月9日在<Genome Biology>上发表题目为& ...

是时候把生信技能树的舞台交给后辈! 粉丝来稿作者:黑川五郎写在前面单细胞转录组以10X公司为主流,单细胞天地公众号详细介绍了cellranger流程,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 面向单细胞的技术革命,让我们得以进入新的研究层面, ...

研究背景先天淋巴细胞(ILCs)是一种免疫细胞,它通过释放可溶性的因素调节对病毒.细菌和寄生虫的早期免疫反应.这些细胞可以根据细胞表面的转录因子及细胞因子被分为三个亚型,每种亚型都有不同的功能. 方 ...

单细胞转录组测序很热,想必很多人都想学习一下.因为大家都喜欢热点,热点好搞基金,更好发文章,这是科研圈的共识.既然这么热,我们就从安装R包开始.这些包还是挺多的,包安装不好,后面的分析就没有办法做了呀 ...

单细胞转录组测序中的批次效应知多少？ （下）