Bioconductor包chimeraviz嵌合RNA可视化 / 开普饭

BRCA1基因为例 1 找到BRCA1在gtf文件中的坐标 zcat /mnt/f/kelly/bioTree/server/wesproject/reference/gencode.v25.anno ...

cancer research杂志在癌症研究领域还蛮出名的,很容易跟Clinical Cancer Research搞混,假如你在这两个杂志发表过第一作者的研究,可以在公众号留言找我,获得一个免费的生 ...

Seurat是目前单细胞数据分析最常用的软件之一,本文介绍下如何在Seurat里做三维的tsne计算以及进行可视化展示. 1.三维坐标计算: 这里假设单细胞数据已经从counts matrix 走到了 ...

转录诱导的嵌合RNA是一种新型生物标志物和治疗靶标,但唾液中肿瘤来源的外泌体嵌合RNA作为生物标志物的价值尚不清楚.在这项研究中,来自暨南大学医学院张灏课题组的研究人员探讨了唾液外泌体GOLM1-NA ...

animalcules-交互式微生物组分析和可视化的R包 animalcules: interactive microbiome analytics and visualization in R Mi ...

推荐:江舜尧编译:莫沉编辑:马莉暨南大学张灏教授团队于近期在<Clinical Cancer Research>上发表题目为<Evaluation of Salivary Ex ...

gplbioc_packagetitle GPL32mgu74a[MG_U74A] Affymetrix Murine Genome U74A Array GPL33mgu74b[MG_U74B] A ...

whatlies 可以与spacy语言模型结合,可视化词向量.安装zh_core_web_md.en_core_web_md和whatlies.具体文档可以查看https://github.com/R ...

与此同时,不少粉丝对GSVA或者ssGSEA分析方法提出了要求,变相催稿.其实GSVA或者ssGSEA是有成熟的工具,我暂时没有找到它们的卖点.不过,我注意到了一个GitHub包,ncborcherd ...

众所周知,发布在bioconductor的包主要是生物信息学相关,在官方可以看到其主要是分成3类: 软件方面的包(包括各种芯片数据处理,NGS数据处理,差异分析等等!) 注释方面的包(第二类是一系列的 ...

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